Den här artikeln behöver källhänvisningar för att kunna verifieras. (2020-06) Åtgärda genom att lägga till pålitliga källor (gärna som fotnoter). Uppgifter utan källhänvisning kan ifrågasättas och tas bort utan att det behöver diskuteras på diskussionssidan.

Malaysias MotoGP 2005 kördes den 25 september på Sepang International Circuit.

Loris Capirossi tog hem sin andra raka seger, medan Valentino Rossi säkrade sin femte raka VM-titel.

Plats	Förare	Märke	Grid	Kvaltid
1	Loris Capirossi	Ducati	1	2.01,731
2	Valentino Rossi	Yamaha	7	2.02,412
3	Carlos Checa	Ducati	8	2.02,419
4	Nicky Hayden	Honda	6	2.02,377
5	Marco Melandri	Honda	9	2.02,660
6	Max Biaggi	Honda	12	2.03,210
7	Kenny Roberts Jr.	Proton KR	5	2.02,315
8	Alex Barros	Honda	11	2.03,013
9	John Hopkins	Suzuki	3	2.02,017
10	Colin Edwards	Yamaha	10	2.02,805
11	Toni Elías	Yamaha	14	2.03,397
12	Makoto Tamada	Honda	15	2.03,974
13	Roberto Rolfo	Ducati	17	2.05,092
14	Shane Byrne	Honda	18	2.06,493
15	Rubén Xaus	Yamaha	16	2.04,010
16	Franco Battaini	Blata	19	2.07,492
17	James Ellison	Blata	20	2.08,352
18	Olivier Jacque	Kawasaki	13	2.03,364
19	Shinya Nakano	Kawasaki	4	2.02,178
20	Sete Gibernau	Honda	2	2.01,867