Bruce Wayne, den ursprungliga Batman, pensionerar sig på grund av sin dåliga hälsa 2019, när hans uppdrag att rädda en kidnappad kvinna går fel och han är nära att använda en pistol, den värsta synden enligt Batman. 20 år senare, 2039, upptäcker Terrence "Terry" McGinnis Batmans identitet efter att den åldrande Bruce Wayne hjälper honom försvara sin mot ett gäng av Jokerz (gatugäng inspirerade av den ursprungliga Jokern). Efter att Terrys pappa blir mördad, söker Terry hjälp av Bruce att hämnas för sin far.

• Skurkar: Jokerz and Derek Powers

Terry stjäl Batmans dräkt för att förfölja sin fars mördare, en professionell bodyguard vid namn Mr. Fixx (George Takei) vars arbetsgivare Derek Powers (Sherman Howard), den nuvarande vd av Wayne-Powers, använder företagets resurser i hemlighet för att utveckla ett biologiskt vapen. Bruce Wayne upptäcker stölden och avaktiverar kostymen, men när han ser den nu hjälplösa Terry återaktiverar han den så att Terry kan hitta Fixx. I slutändan dyket Wayne upp i Terrys hem för att anställa honom som Waynes "assistent".

• Skurkar: Derek Powers and Mr. Fixx

Terry, som just börjat jobba för Bruce Wayne, står inför Inque, en berömd hamnskiftare anställd för att sabotera FoxTeca, ett företag grundat av Lucius Foxs son.

• Skurk: Inque

Willie Watt, en nörd på gymnasiet som har blivit retad alltför många gånger, stjäl en byggrobot från sin pappa för att skrämma sin mobbare Nelson Nash. Men när Batman försöker stoppa roboten blir den mentalt bunden till Willie och ger honom mer kraft än han någonsin drömt om.

• Skurk: Willie Watt

Wayne-Powers bygger en ny kropp för Victor Fries, mer känd som Batmans fiende Mr. Freeze, i hopp om att en liknande behandling kan upphäva Derek Powers transformation till Blight. Till synes botad för sitt behov av extrem kyla försöker Fries försona sig med sig själv, men varken den f.d. Batman, Bruce Wayne, eller hans tidigare offer litar på honom, och hans välgörare har sina egna planer. Waynes protegé, Terry McGinnis, försöker hjälpa Fries.

• Skurk: Mr. Freeze

The Terrific Trio, en grupp vetenskapsmän som blev superhjältar efter att ha fått superkrafter i ett experiment som gick fel, tog sig in i Gotham och blev mediasensationer. Men Magma, Freon och 2-D Man lär sig snart att olyckan som gav dem deras krafter inte var en olycka. Trion är inspirerad av Fantastic Four, där 2D Man är Mr. Fantastic, Magma är en kombination av Thing och Human Torch och Freon kan sprida sina molekyler från varandra tills hon blir svår att se och hennes is-strålar kan bilda skyddande sköldar, vilket gör henne analog med Invisible Woman.

• Skurk: The Terrific Trio

Derek Powers anställer Shriek, en före detta ljudtekniker, numera superskurk, som en del av ett utarbetat system för att få bort Bruce Wayne från hans kontroll över Wayne-Powers. (Notering: I det här avsnittet ser Bruce en affisch av en efterlyst Joker, som är den enda bilden på Jokern utanför filmen.)

• Skurk: Shriek

Terry måste ta itu med både avslag från sin flickvän, Dana, och en grupp av Bruces gamla fiender, Royal Flush Gang, som efterbildar sig efter att kortleks-rangordningen. Det ser ljust ut för Terry när han möter en tjej vid namn Melanie som verkar dela hans problem. Detta avsnitt hänvisar till Catwoman när Bruce säger till Terry "Låt mig berätta om en kvinna som heter Selina Kyle."

• Skurk: The Royal Flush Gang

"Slappers", illegala steroidplåster som innehåller drogen Venom, är populära hos Hill High Schools idrottare, och Bruce misstänker att en av hans gamla fiender, Bane, kan vara delaktig i produktionen. Men Terry finner att Bane har blivit en svag gammal man på grund av hans ständiga användning av det giftiga läkemedlet och en forskare som heter Chappell använder drogen för sina egna behov. Chappell utsätts för alltför mycket gift, vilket leder till att han blir halvdöd och krossad under trasiga spillror.

• Skurk: Jackson Chappell

En skurk som kallas Spellbinder använder hypnotisk teknik för att utföra en rad rån, vilket gör hans offer till ofrivilliga medbrottslingar.

Inque frigörs av en kärlekskrank arbetare vid en kryogenisk anläggning. I sin muterade form letar hon efter de kemikalier som tillåter henne att återfå sin mänskliga form och ta hämnd på Batman och den "mystiska gamla mannen" som hjälper honom.

• Skurk: Inque

En lönnmördare vid namn Curare skickas efter D.A. Sam Young, kommissarie Barbara Gordons make. Batmans försök att skydda Young leder till konflikter med Gordon, och några överraskande uppenbarelser om det förflutna.

• Skurk: Curare

När Derek Powers Blight persona långsamt förstör det som var kvar av hans normala liv, vänder han sig till sin son för hjälp. Paxton Powers verkar villig att hjälpa Batman, men tyvärr går bedrägeri och girighet i familjen.

• Skurkar: Blight and Paxton Powers

En ny kroppsförändringsutveckling kallad splicing, som kombinerar mänskligt DNA med djur-DNA, tar Neo-Gothams modevärld med storm. Medan distriktsåklagaren vill få det att bli olagligt eftersom det orsakar en ökning av aggressivt beteende, insisterar dr. Abel Cuvier, skaparen av processen, på att ingreppet är säkert. Men Batman upptäcker snart att Cuvier planerar att attackera distriktsåklagaren för att tysta honom.

• Skurk: Dr. Abel Cuvier

Batman blir involverad när Terrys vän och hennes adoptivpappa hemsöks av kusliga, människoliknade varelser gjorda av jord och lär sig snart att de har en skrämmande koppling till flickans biologiska far.

• Skurk: Earthmover

En grupp Jokerz stjäl en prototyp av ett militärfordon och förstör Neo-Gotham, medan Batman och fordonets designer försöker återställa maskinen innan den skadade reaktorn förvandlas till en flygande bomb.

• Skurk: Jokerz

Terry måste slåss mot Batmandräkten när den tas över av den virtuella själen av död kommunikationstjänsteman Robert Vance, en man som bokstavligen har blivit ett "spöke i maskinen". Utan hjälp av sin dräkt måste Terry rädda männens sonson från att bli ett kärl för Vances virtuella hjärna.

• Skurk: Robert Vance

Ledaren för ett gäng av Jokerz planerar hämnd mot Max Gibson, en klasskamrat som överträffar honom i skolan. Terrys ansträngningar att hjälpa henne kompliceras av hennes ansträngningar att ta reda på Batmans sanna identitet. Hon är övertygad att han är student i skolan och att han är en av Jokerz. Detta avsnitt hänvisar till Batman: The Animated Series när Maxine säger till Terry: "Du kallar mig Robin, och jag drar" på vilken Terry svarar "Inget problem, Alfred."

• Skurk: Jokerz

Stalker, en cybernetiskt förstärkt storviltsjägare, kommer till Neo-Gotham för att söka det som han tror är det enda bytet som på jorden som är värdigt honom: Batman.

• Skurk: Stalker

Ten (Melanie Walker) från Royal Flush Gang återvänder på ett uppdrag för att rädda sin familj, som har fångats av Jokerz. När Melanie ber Terry om hjälp, måste han bestämma om han vill riskera sitt förhållande till Dana, och om Batman verkligen kan lita på Ten.

• Skurk: Jokerz and Royal Flush Gang

När flera av Hill High-studenter hamnar i koma på sjukhus leder Batmans utredning till skurken Spellbinder, som får tonåringar beroende av virtuella verklighetsfantasier och tvingar dem att stjäla åt honom.

• Skurk: Spellbinder

Dana känner sig ignorerad och besviken på Terry för många gånger, och börjar få rosor från en hemlig beundrare. När hon bortförs av den mystiska mannen Patrick Fitz, en pojke som bor i kloakerna på grund av sitt råttliknande utseende, kan Batman vara den enda som kan rädda henne.

• Skurk: Patrick

Terry får mystiska visioner från en ung tjej som ber honom om hjälp. Hans sökande efter henne leder till konfrontation med en grupp människor med otroliga psykiska krafter som kallas Brain Trust. (Notering: En medlem av Brain Trust avslöjas senare i Justice League Unlimited att vara Edgar Mandragora, son till Steven Mandragora, mannen som beordrade mordet på Huntress föräldrar i DCAU)

• Skurk: Brain Trust

Efter flera oförklarliga händelser tror alla i Terrys klass att spöket av en död student hemsöker skolan. Men Batman upptäcker snart att orsaken är Willie Watt, som har utvecklat nya kraftfulla psykiska förmågor.

• Skurk: Willie Watt

Shriek vill hämnas och använder sin kunskap om ljud för att ta bort Neo-Gothams förmåga att kommunicera. Hans pris för att återställa allt till det vanliga? Batmans liv.

• Skurk: Shriek

Howard Groote, en hopplös nörd, köper en olaglig android i form av en vacker tjej för att hon ska verka vara hans flickvän. Hans plan får snart bakslag när "Cynthia", som är programmerad att vara hängiven åt Howard, blir farligt possessiv.

• Skurk: Cynthia

När kommissarie Barbara Gordon bevittnar Batman döda en motståndare i kallt blod, finner Terry sig själv efterlyst medan han försöker upptäcka den verkliga brottslingen och bevisa sin oskuld.

• Skurk: Spellbinder

Bruce är bortrest när Curare återvänder till Neo-Gotham och söker efter de sista personerna i sitt tidigare umgänge som efter hennes misslyckade uppdrag dödsdömde henne. Curare, den sista överlevande medlemmen av League of Assassins, tvingar Batman att skydda sig från Curares vrede genom att placera en bomb utrustad med en deadman-knapp i staden. Det blir ännu mer komplicerat när Max ser sig inblandad i en instabil situation.

• Skurk: Curare

Ett nytt program för problembarn blir en populär sista utväg bland föräldrarna i Gotham, men "The Ranch" är inte helt som det verkar. När Terrys vän Chelsea Cunningham skickas till The Ranch, vill Terry undersöka programmet, men det blir mer än han klarar av.

• Skurk: Dr. David Wheeler

Efter att ha förlorat sitt jobb som vapendesigner, övergår styvfadern till en av Terrys vänner till brottslighet för att få pengar, som superskurken Armory.

En skvallertidningsreporter förvärvar tekniken att bli okroppslig och blir den ultimata tjuvtittare. När han upptäcker Batmans identitet hotar han att avslöja den på nationell tv, men upptäcker snart att tekniken har en negativ inverkan på hans kropp.

• Skurk: Ian Peek

Terry måste ta med sig en datorsimulerad "bebis" överallt - även som Batman - för att få betyg i hemkunskap. Under tiden härjar en familj juveltjuvar i Neo-Gotham och stjäl ovärderliga rubiner.

• Skurk: Ma Parker

En holomorfisk militär android har rapporterats tappat kontrollen, och Terry behöver hitta honom innan han dödar någon. Men är androiden verkligen ur kontroll, eller har han bara fått ett samvete?

• Skurk: Mr. Bennett

Batman samarbetar motvilligt med sin tidigare fiende, Stalker, för att få tag i en slug kriminell som heter False-Face, som har stulit ett farligt virus för en kriminell organisation kallad KOBRA.

• Skurk: False-Face

En bionik-designer har tvingats ge ett gatugäng robotimplantat efter att de kidnappat hans fru. För att stoppa dem behöver Batman en speciell "kill-phrase" för att stänga av implantaten, men kan han övertyga designern att ge den till honom?

• Skurk: The April Moon Gang

En virtual-reality speldesigner använder tre tonåriga fans hängivenhet till spelets universum för att eliminera sina fiender och rivaler (inklusive en inspirerad av författarna Bruce Vilanch och Gary Gygax).

• Skurk: Simon Harper

En ny vigilant som kallar sig Payback hämnas på plågorna av flera oroliga tonåringar, som alla är i samma terapigrupp. När Terry går undercover i gruppen för att hitta den skyldige, börjar han misstänka doktorn som kör sessionerna, men Paybacks verkliga identitet visar sig vara någon som ingen hade förväntat sig.

• Skurk: Payback

Shriek fångar Batman i de övergivna tunnlarna under Neo-Gotham för att hämnas, och Bruce måste alliera sig med Max för att hitta honom.

• Skurk: Shriek

När Ace försvinner tänker Bruce tillbaka på sitt första möte med Ace. Terry upptäcker en underjordisk hundkampsorganisation. "Denna episod är officiellt del av säsong tre, men släpptes på Säsong 2 DVD Boxset och inte på Säsong 3."

• Skurk: Ronny Boxer

Royal Flush-gänget återvänder, utom Ten, i ett försök att återfå sitt rykte. Men eftersom de är lurade av Paxton Powers, försöker både Paxton och gänget att öka sina bankkonton genom Bruce Wayne.

• Skurkar: Paxton Powers and the Royal Flush Gang

Batman stöter på en ny, uppenbarligen osårbar fiende som heter Repeller, som använder teknik som liknar en prototyp som Wayne-Powers medicinska division har utvecklat.

• Skurk: Repeller

Sedan Inques senaste arbetsgivare bedragit henne och sprängt henne med ett experimentellt vapen som gör att hennes kropp långsamt löses upp, tvingas hon vända sig till någon hon inte har sett på år: sin dotter.

• Skurk: Inque

När en vän från Terrys oroliga förflutna, Charlie "Big Time" Bigelow, återvänder, försöker Terry stoppa honom från att upprepa sina misstag och återvända till fängelset. Men när Charlie hjälper ett gäng skurkar råna ett Wayne-Powers forskningslaboratorium, utsätts han för en farlig experimentell kemikalie och muterar till en monstruös jätte.

• Skurk: Big Time

Bruce Waynes tidigare kärlek, Talia, återvänder för att erbjuda honom chansen att vara evigt ung. Bruce och Terry upptäcker emellertid en mörk hemlighet. För decennier sedan, efter att Talia tog ställning med Bruce mot sin far, blev Ra's al Ghul lämnad dödligt skadad utom Lazarus Pits förmåga att läka. För att rädda sig själv offrade Ra's al Ghul sin dotter genom att använda en dator för att skriva sina tankar och minnen i Talias kropp, radera hennes medvetande och ersätta det med sitt eget. Efter att ha förbättrat datorn bestämmer Ra's al Ghul att det är dags att flytta in i en ny kropp: Bruce Wayne.

• Skurk: Ra's al Ghul

Batman accepterar motvilligt att hjälpa en genetiskt förbättrad gorilla att hitta tjuvjägaren som kidnappade hans mamma.

• Skurk: James Van Dyle

Superman drar Batman in i Justice League när han misstänker att det finns en förrädare bland dem. Trots Bruces varning om att inte gå med, gör Terry det och upptäcker snart en konspiration mot ligan.

• Skurk: Starro the Conquerer

För att komma till botten med problemet med Justice League måste Batman slåss mot sina egna lagkamrater - inklusive Superman själv. Han måste söka hjälp från Bruce som kände till en gammal fiende till Starro the Conquerer. Även om han besegrar dem och en tacksam Superman erbjuder honom att gå med i Justice League, vägrar Batman och förstår varför Bruce inte gick med i ligan på heltid i första hand.

• Skurk: Starro the Conquerer

Big Time återvänder till Neo-Gotham, vilket orsakar problem för både Batman och hans alter-ego Terry McGinnis, som fortfarande känner sig skyldig till vad som hände med honom.

• Skurk: Big Time

Terry skickas till Bruces gamla vän, Kairi Tanaka, för att fräscha upp sina stridskonster och blir oavsiktligt vän med tronföljaren för den kriminella organisationen KOBRA.

• Skurk: KOBRA

Efter att KOBRA:s ledare kidnappar Max för att bli hans fru, är Batman tvungen att inte bara rädda henne, utan för att stoppa KOBRA:s komplott måste han låta världen återvända till tiden när dinosaurier härskade ... med deras genklyvd dinosauriska män som dominerande arten .

• Skurk: KOBRA

Zeta återvänder till Neo-Gotham City för att leta efter sin skapare, men grips av Mad Stan som gör om honom till en tidsinställd bomb. Batman och Ro måste spåra Zeta innan tiden rinner ut.

• Skurk: Mad Stan

Terry berättar för Max om ett av hans sina äventyr som Batman, då han avslöjade sitt ansikte för ett barn och oavsiktligt gjorde pojken ett mål för KOBRA.