Även om Kaukonen var en av de i Jefferson Airplane som uppmärksammades minst anser många att hans gitarrspel var ett viktigt karaktäristiskt drag i gruppen.[2] När bandet splittrades i början av 1970-talet bildade han gruppen Hot Tuna tillsammans med Jack Casady, som varit basist i Jefferson Airplane.[3] Kaukonens solodebutalbum Quah gavs ut 1974. Han har sedan dess fortsatt ge ut soloalbum, men även varit med i återföreningar av både Jefferson Airplane och Hot Tuna.