John Murray, 2:e earl och 1:e markis av Atholl, född den 2 maj 1631, död den 6 maj 1703, var en skotsk ädling, son till John Murray, 1:e earl av Atholl, far till John Murray, 1:e hertig av Atholl och Charles Murray, 1:e earl av Dunmore.

Atholl företog 1653-54 en av Monck undertryckt resning i Skottland till Karl II:s förmån, erhöll efter restaurationen flera höga ämbeten och intog vid 1688 års revolution i det längsta en vacklande hållning, bestämde sig omsider för att hylla Vilhelm och Maria, men var sedermera gång på gång invecklad i jakobitiska stämplingar. Murray blev 1642 earl av Atholl efter sin far, 1670 earl av Tullibardine efter en kusin, och upphöjdes 1676 till markis av Atholl.

Den här artikeln är helt eller delvis baserad på material från Nordisk familjebok, Murray, 1. John M., 2:e earl och l:e markis af Atholl, 1904–1926.