I delstatsvalet 2003 var INPT allierade med Kongresspartiet. INPT lanserade 18 kandidater och Kongresspartiet 42. Sex INPT-kandidater valdes, och totalt fick partiets kandidater 189 186 röster. Valet vanns av Left Front.
INPT drabbades av ett allvarligt bakslag i mitten av 2003, när en grupp TTAADC-ledamöter under ledning av Hiren Tripura bröt sig ur och bildades National Socialist Party of Tripura. En av INPT:s högsta ledare, Shyamcharan Tripura, ställde sig på utbrytarnas sida. NSPT lyckades, med stöd från CPI(M):s ledamöter i TTAADC, vinna majoritet i församlingen och det som blev kvar av INPT hamnade i opposition.