Åren 1917-23 var Lennmalm (som även var medlem i Svenska sällskapet för rashygien) rektor för Karolinska institutet. Under tiden som rektor föreslog Lennmalm år 1918 att Nobelstiftelsen skulle finansiera ett rasbiologiskt institut. Nobelkommittén för medicin röstade enhälligt ja, men året därpå föll frågan med endast en rösts marginal (9 mot 8) i Karolinska Institutets lärarkollegium.[3] Istället framfördes då förslag om ett statligt institut, och 1921 bildades Statens institut för rasbiologi i Uppsala.
Bibliografi i urval
Om lokalisationen i hjärnbarken af afasiens olika former (1886, diss.)
Skarlakansfeberns uppträdande i Sverige (i Uppsala universitets årsskrift 1889)
Om de s.k. traumatiska neuroserna (i "Hygiea" 1893)
Om kombinerade skleroser i ryggmärgens bak- och sidosträngar (i "Hygiea" 1894)
Om sjukdomar, som bero på föreställningar och som botas genom föreställningar (i "Hygiea" 1896)
Svenska läkarsällskapets historia 1808-1908 (1908)
Karolinska medikokirurgiska institutets historia (tillsammans med Severin Jolin, 1910)