Ruffy blev 1880 advokat, invaldes 1882 i sin hemkantons stora råd och i schweiziska nationalrådet, blev 1885 ledamot av Vauds statsråd och var 1887 dettas president. Ruffy blev 1889 nationalrådets president och invaldes 1893 i förbundsrådet efter Ruchonnet, vilken som advokat och liberal politiker varit hans läromästare. År 1898 var Ruffy förbundsrådets president; han utträdde ur förbundsrådet i oktober 1899 för att överta direktörsposten i världspostföreningen.