Organisationen bildades 1901 ur Commonwealth Naval Forces efter Australiska statsförbundets grundande, bestående av de tidigare brittiska koloniernas, de nuvarande staternas, flottor.[1] Det nuvarande manet antogs 1911.[1]
Idag är RAN en av de största och mest avancerade sjöstridskrafterna i Stillahavsregionen, med en betydande närvaro i Indiska oceanen och deltagande över hela världen som stöd för militära och fredsbevarande kampanjer. Flottan består av omkring 60 fartyg, inklusive fregatter, ubåtar, patrullfartyg och underhålls- samt transportfartyg. Sedan 1982 har Australien inte längre något hangarfartyg i flottan. Nutida uppdrag för flottan inkluderar att bistå den internationella styrkan i Irak, stöd för FN:s insatser i Östtimor samt insatser tillsammans med Nya Zeeland på Salomonöarna.
Australiens flotta har två huvudbaser: Fleet Base East/HMAS Kuttabul i Sydney på östkusten samt Fleet Base West/HMAS Stirling utanför Perth på västkusten.