Det byggde 1816 som Auburn Prison, och var andra delstatsfängelset i New York (efter Newgate i New York City, 1797-1828), och det var här som elektriska stolen först användes 1890, och fängelset har givit namn till Auburnsystemet, ett program som tillämpades under 1800-talet för rehabilitering av gångar. Fängelset bytte namn till Auburn Correctional Facility under 1970-talet.