Bonaparte anklagades 1836 för konspirationer mot Roms regering, utvandrade och bosatte sig 1848 i Frankrike. Som medlem av lagstiftande församlingen stödde han sin kusin president Ludvig Napoleons planer. Efter dennes fall 1870 bosatte han sig åter i Italien.
Antoine var från 1839 gift med Caroline Cardinali, men efterlämnade inga barn.
