Muhammed företog enligt Koranenssura 17 en nattlig resa från den heliga moskén i Mecka till, enligt traditionen, nuvarande Tempelberget i Jerusalem där al-Aqsa nu är belägen.[6]
Böneriktning
Under islams första tid bad muslimerna med böneriktning mot Jerusalem[4] och Tempelberget, men ändrade enligt Koranens sura 2:142-151[7] senare riktningen mot Kaba.
Kristet högkvarter
När Jerusalem intogs av de kristna 1099 gjorde de al-Aqsamoskén till högkvarter för Tempelherreorden tills Saladin återtog staden 1187.[8]