На територији Естоније налази се укупно 47 насељених места са званичним административним статусом града. Од тога свега три града имају више од 50.000 становника, и то Талин (430.000), Тарту (око 100.000) и Нарва (62.000 становника). Чак 33 званична града имају мање од 10.000 становника.

№	Град	Изворно име	Статус града	Попис 1979.	Попис 1989.	Попис 2011.	Процена 2014.	Округ
1.	Талин	Tallinn	1248.	441.800	478.974	400.781	429.829	Харјума
2.	Тарту	Tartu	13. век	104.381	113.420	101.241	97.843	Тартума
3.	Нарва	Narva	1345.	75.909	81.221	68.812	62.068	Ида-Вирума
4.	Парну	Pärnu	1251.	54.051	52.389	45.591	41.523	Парнума
5.	Кохтла-Јарве	Kohtla-Järve	1946.	87.472	62.059	47.797	38.197	Ида-Вирума
6.	Виљанди	Viljandi	1283.	22.368	23.080	20.800	18.490	Виљандима
7.	Раквере	Rakvere	1302.	19.011	19.822	17.120	16.338	Лане-Вирума
8.	Марду	Maardu	1980.	---	16.052	16.733	15.945	Харјума
9.	Силамае	Sillamäe	1957.	16.157	20.561	17.232	14.586	Ида-Вирума
10.	Куресаре	Kuressaare	1563.	14.207	16.166	14.922	14.071	Сарема
11.	Виру	Võru	1784.	16.767	17.496	14.905	13.171	Вирума
12.	Валга	Valga	1584.	18.474	17.722	14.352	13.427	Валгама
13.	Хапсалу	Haapsalu	1279.	13.035	14.617	12.058	10.811	Ланема
14.	Јихви	Jõhvi*	1938.	---	15.607	12.153	12.354	Ида-Вирума
15.	Паиде	Paide	1291.	9.641	10.849	9.647	8.547	Јарвама
16.	Кејла	Keila	1938.	7.194	10.072	9.409	9.747	Харјума
17.	Кивјили	Kiviõli	1946.	11.050	10.390	7.435	5.814	Ида-Вирума
18.	Тапа	Tapa*	1926.	10.851	10.439	6.799	8.085	Лане-Вирума
19.	Пилва	Põlva*	1993.	---	7.038	6.461	10.005	Пилвама
20.	Јигева	Jõgeva	1938.	5.289	7.035	6.430	5.553	Јигевама
21.	Тири	Türi*	1926.	6.626	6.862	6.330	9.800	Јарвама
22.	Елва	Elva	1938.	6.358	6.325	6.029	5.807	Тартума
23.	Рапла	Rapla*	1993.	5.599	6.271	5.774	9.473	Раплама
24.	Сауе	Saue	1993.	---	4.395	4.959	5.924	Харјума
25.	Пилцама	Põltsamaa	1926.	4.893	5.207	4.858	4.380	Јигевама
26.	Палдиски	Paldiski	1783.	7.311	7.690	4.261	4.067	Харјума
27.	Синди	Sindi	1938.	4.428	4.548	4.186	4.138	Парнума
28.	Кунда	Kunda	1938.	4.828	5.037	3.896	3.360	Лане-Вирума
29.	Кардла	Kärdla*	1938.	3.426	4.139	3.775	4.835	Хијума
30.	Локса	Loksa	1993.	---	4.315	3.493	2.809	Харјума
31.	Тирва	Tõrva	1926.	3.157	3.546	3.209	2.913	Валгама
32.	Кехра	Kehra*	1993.	3.679	4.053	3.228	5.752	Харјума
33.	Рапина	Räpina*	1993.	3.247	3.488	2.968	5.095	Пилвама
34.	Нарва-Јиесу	Narva-Jõesuu	1993.	3.135	3.754	2.997	2.902	Ида-Вирума
35.	Тамсалу	Tamsalu*	1993.	---	2.978	2.615	3.991	Ланема
36.	Килинги-Ниме	Kilingi-Nõmme*	1938.	2.507	2.504	2.226	4.188	Парнума
37.	Отепа	Otepää*	1936.	2.289	2.424	2.219	4051	Валгама
38.	Каркси-Нуја	Karksi-Nuia*	1993.	---	---	1.993	3.507	Виљандима
39.	Писи	Püssi*	1993.	1.869	2.532	1.874	3.232	Ида-Вирума
40.	Мустве	Mustvee	1938.	---	1.994	1.756	1.449	Јигевама
41.	Вихма	Võhma	1993.	---	1.983	1.599	1.391	Виљандима
42.	Лихула	Lihula*	1993.	1.624	1.872	1.499	2.430	Ланема
43.	Анцла	Antsla*	1938.	1952.	1.688	1.552	3.517	Вирума
44.	Абја-Палуоја	Abja-Paluoja*	1993.	---	---	1.422	2.295	Виљандима
45.	Суре-Јани	Suure-Jaani*	1938.	1.653	1.503	1.327	5540	Виљандима
46.	Каласте	Kallaste	1938.	---	1.361	1.219	952	Тартума
47.	Мијсакила	Mõisaküla	1938.	---	1.349	1.169	864	Виљандима

* Градови који су делови већих општина.^[1]

Насеља која су изгубила званичан статус града у Естонији:

• Ахтме (Ahtme), 1953–1960, 1993–1995, инкорпориран у град Кохтла-Јарве;
• Ивангород (Jaanilinn), 1617-1649, првотно уједињен са Нарвом, од 1945. у саставу Русије;
• Мустла (Mustla), 1938-1979, враћена на ниво полуурбаног насеља;
• Ниме (Nõmme), 1926-1940, инкорпориран у Талин;
• Печори (Petseri), од 1776, у границама Русије од 1945;
• Томпеа (Toompea), 1248/1265/1288-1785, 1796-1878, инкорпориран у Талин;
• Вана-Парну (Vana-Pärnu), 1251-1617, инкорпориран у Парну.

• Административна подела Естоније
• Општине Естоније

Списак градова у Естонији на Викимедијиној остави.