Префектура Кефалонија и Итака (грч.Νομός Κεφαλονιά και Ιθάκη) је некадашња префектура у Јонским острвима, у Грчкој. Управно средиште префектуре и највеће место у префектури био је град Аргостоли на Кефалонији. Префектура је 2011. године подељена на два округа, Кефалонију и Итаку.
Као што стоји у називу префектуре префектури чинила су два значајна острва у Јонском мору: