Учествовало је укупно 20 рагби клубова из Европе, који су били подељени у 5 група. На крају је "Клермон Оверња" освојио трофеј, тако што је у финалу у Енглеској био бољи од Бата.[1]
20 екипа подељено је у 5 група и играло се двокружно. 4 бода се добијало за победу и 2 бода за нерешено, а у завршницу такмичења пролазиле су само првопласиране екипе. Њима су се придружиле и 3 екипе из Купа шампиона. Један бонус бод се добијао за 4 или више постигнутих есеја на једној утакмици и један бонус бод за пораз мањи од 8 поена разлике.
Групна фаза се играла од 20. октобра 2006, до 20. јануара 2007.
После шест кола у нокаут фазу челинџ купа отишли су Њупорт, Сараценс, Брив, Бат и Клермон као првопласирани клубови и Њукасл, Глазгов и Бристол као другопласирани клубови.
У нокаут фази Челинџ купа нашли су се четири енглеска клуба, два француска, један шкотски и један велшки. Клермон је на путу до финала елиминисао Њукасл и Њупорт, а Бат је био бољи од Бристола и Сараценса. Финале је одиграно у престоници Уједињеног Краљевства, а Клермон је надиграо Бат и тако по други пут освојио Челинџ куп.
