Пропозицијама завршног дела такмичења за Куп Србије у фудбалу 2011/12. донетих од стране Извршног одбора Фудбалског савеза Србије15. јула2009. године предвиђено је да у завршном делу такмичења учествују:
5 (пет) клубова победника такмичења за Фудбалски куп Србије организованих у оквиру Фудбалских савеза покрајина, региона и ФС Београда.
У завршно такмичење укључују се и клубови који су у завршеном такмичењу за 2010/11. годину испали у нижи степен такмичења - Прву лигу и одговарајуће Српске лиге. На основу ових критеријума у завршно такмичење пласирало се 39 клубова, па је потребно да се одигра 7 утакмица предтакмичења да би се такмичење свело на 32 клуба учесника шеснаестине финала.
У претколу одиграном 5. септембра2012. гоодине су се састали победници куп такмичења по регионима и најслабије пласирана екипа из прошле сезоне у Првој лиги Србије. Игра се једна утакмица код првоименоване екипе. У случају нерешеног резултата после регуларног тока утакмице, одмах се изводе једанаестерци. Резултати постигнути након извођења једанаестераца приказани су у загради.
Жреб парова шеснаестине финала Купа Србије у сезони 2012/13. обављен је 13. септембра2012. у просторијама Спортског центра Фудбалског савеза Србије, у Старој Пазови. (Уместо Смедерево играо је ЖФК Смедерево.)
Сви мечеви одиграни су 26. септембра2012. године. Према пропозицијама такмичења, уколико се утакмица заврши нерешеним резултатом, одмах ће се изводити једанаестерци. Резултати постигнути након извођења једанаестераца приказани су у загради.
Жреб парова осмине финала Купа Србије у сезони 2012/13. обављен је 4. октобра2012. у просторијама Спортског центра Фудбалског савеза Србије, у Старој Пазови.
Сви мечеви одиграни су 24. октобра2012. године, осим утакмице Партизан - Борац Чачак која је била заказана за 31. октобар. Према пропозицијама такмичења, уколико се утакмица заврши нерешеним резултатом, одмах ће се изводити једанаестерци. Резултати постигнути након извођења једанаестераца приказани су у загради.
Жреб парова четвртине финала Купа Србије у сезони 2012/13. обављен је 2. новембра2012. у просторијама Спортског центра Фудбалског савеза Србије, у Старој Пазови.
Сви мечеви одиграни су 21. новембра2012. године. Према пропозицијама такмичења, уколико се утакмица заврши нерешеним резултатом, одмах ће се изводити једанаестерци. Резултати постигнути након извођења једанаестераца приказани су у загради.
