Смит је постао официр у војсци САД 1845. године. По избијању грађанског рата 1861. иступа из војске, а Флорида је прогласила отцепљење од Уније. У јуну 1861. је имао чин бригадног генерала и у октобру исте године је унапређен у генерал-мајоравојске Конфедерације. Истакао се за време Брагове инвазије Кентакија (1862) и на Ричмонд, где је поразио генерала севера Вилијама Нелсона (30. августа исте године).[2] Од фебруара 1863. до краја рата, Смит је командовао снагама западно од Мисисипија (Трансмисисипи, подручје под ингеренцијом конфедералних држава). Потписао је предају својих трупа 26. маја 1865, а после рата је био директор железничке компаније и затим универзитетски професор.
Био је ожењен са Кеси Селден (1836–1905), имали су једанаесторо деце, пет синова и шест кћери.
^Cunningham, Sumner A.; Sons of Confederate Veterans (Organization); Confederated Southern Memorial Association (U.S.); United Confederate Veterans; United Daughters of the Confederacy (1922), Confederate Veteran, S.A. Cunningham
Prushankin, Jeffery S (2005). A Crisis in Confederate Command: Edmund Kirby Smith, Richard Taylor and the Army of the Trans-Mississippi. Baton Rouge: Louisiana State University Press. ISBN978-0-8071-3088-9..
Smith, Ephraim Kirby (2006), To Mexico with Scott: Letters of Captain E. Kirby Smith to His Wife, edited and with Introduction by R.M. Johnston, scanned and reissued,