Molekulsko prepoznavanje

Kristalna struktura kratkog peptida L-Lys-D-Ala-D-Ala (prekursora bakterijskog ćelijskog zida) vezanog za antibiotik vankomicin putem vodoničnih veza[1]
Kristalna struktura dve izoftalne kiseline vezene za molekul domaćina putem vodoničnih veza[2]

Molekulsko prepoznavanje je specifična interakcija između dva ili više molekula putem nekovalentnog vezivanja kao što je vodonično vezivanje, metalna koordinacija, hidrofobne sile, Van der Valsove sile, π-π interakcije, elektrostatični i/ili elektromagnetni[3] efekti. Domaćin i gosti koji učestvuju u molekulskom prepoznavanju pokazuju molekulsku komplementarnost.[4][5]

Biološki sistemi

Molekulsko prepoznavanje ima važnu ulogu u biološkim sistemima. Ono se javlja između receptora i liganda, antigena i antitela, DNK i proteina, šećera i lektina, RNK i ribozoma, itd. Jedan važan primer molekulskog prepoznavanja je antibiotik vankomicin koji se selektivno vezuje sa peptidima sa terminalnim D-alanil-D-alaninom u bakterijskim ćelijama putem pet vodoničnih veza. Vankomicin je letalan za bakterije, jer se nakon vezivanja peptidi ne mogu koristiti za konstrukciju bacterijskog ćelijskog zida.

Reference

  1. ^ Knox, James R.; Pratt, R. F. (1990). „Different modes of vancomycin and D-alanyl-D-alanine peptidase binding to cell wall peptide and a possible role for the vancomycin resistance protein” (Free full text). Antimicrobial agents and chemotherapy. 34 (7): 1342—7. PMC 175978 Слободан приступ. PMID 2386365. 
  2. ^ Bielawski, Christopher; Chen, Yuan-Shek; Zhang, Peng; Prest, Peggy-Jean; Moore, Jeffrey S. (1998). „A modular approach to constructing multi-site receptors for isophthalic acid” (Free full text). Chemical Communications (12): 1313—4. doi:10.1039/a707262g. 
  3. ^ Cosic I (1994). „Macromolecular bioactivity: is it resonant interaction between macromolecules?—theory and applications”. IEEE transactions on bio-medical engineering. 41 (12): 1101—14. PMID 7851912. doi:10.1109/10.335859. 
  4. ^ Jean-Marie Lehn (1995). Supramolecular Chemistry. Weinheim: Wiley-VCH. ISBN 978-3-527-29312-4. OCLC 315928178. 
  5. ^ Gellman Samuel H. (1997). „Introduction: Molecular Recognition”. Chemical reviews. 97 (5): 1231—1232. PMID 11851448. doi:10.1021/cr970328j. 

Literatura

Spoljašnje veze