Metabolomika je naučna studija hemijskih procesa u kojima učestvuju metaboliti. Metabolomika je sistematsko izučavanje jedinstvenih hemijskih otisaka koji su specifčni za ćelijske procese. Ona je studija motaboličkih profila malih molekula.[1]Metabolom je kolekcija svih metabolita u biološkoj ćeliji, tkivu, organu ili organizmu, koji su krajnji produkti ćelijskih procesa.[2] Dok celokupni podaci iRNKgenske ekspresije i proteomskih analiza ne sadrže potpunu informaciju o ćelijskim procesima, metabolički profil može da pruži trenutnu sliku ćelijske fiziologije. Jedan od izazova sistemske biologije i funkcionalne genomike je integracija proteomske, transkriptomske, i metabolomske informacije da bi se formirala kompletnija slika živih organizama.