Хромозом 3 је аутозомни хромозом у хуманом кариотипу је трећи по величини, изграђен од 214 милиона базних парова. Према положају центромере припада метацентричним хромозомима. Заједно са хромозомима 1 и 2 сврстан је у А групу хромозома.
Мапирани гени и болести
На хромозому 3 мапирани су гени за следеће болести: