Sezona 1998/99 Slovenske hokejske lige je bila osma sezona slovenskega prvenstva v hokeju na ledu. Naslov slovenskega prvaka so petič osvojili hokejisti HK Olimpija, ki so v finalu s 3:0 v zmagah premagali HK Slavija. Moštvo HK Acroni Jesenice je bilo zaradi neudeležbe dveh tekem državne lige zaradi stavke igralcev avtomatsko izklučena iz prvenstva.
Končnica
Finale
- Igralo se je na tri zmage po sistemu 1-1-1-1-1.
Končna lestvica prvenstva
- HK Olimpija
- HK Slavija
- HK Bled
- HK HIT Casino Kranjska Gora
- HDK Proton avto Maribor
- HK Cloetta Triglav Kranj
- HDK Bled
Najboljši strelci
- G - goli, P - podaje, T - točke