2023 Občina Slovenska Bistrica – Podelitev naziva Častni občan občine Slovenska Bistrica[3]
2022 Časnik DELO podeli naziv – Delova osebnost leta 2022[4]
2022 IZS – Nagrada Inženirske zbornice Slovenije za inženirsko odličnost[5]
2022 Najvišje akademsko priznanje - Častni doktorat Univerze v Mariboru; Za izjemne dosežke na področju razvoja novih konstrukcijskih zasnov mostov, projektiranja in izgradnje najzahtevnejših mostov v evropskem in svetovnem merilu ter prispevek k večanju ugleda Univerze v Mariboru[6]
2022 Državno odlikovanje Republike Slovenije – Srebrni red za zasluge - Za izjemne dosežke v projektiranju in izgradnji velikih mostov v slovenskem in evropskem merilu[7]
2022 Hrvatska komora inženjera građevinarstva: Nagrada KOLOS za izjemne dosežke v inženirski stroki – Projekt Most Pelješac[8]
2021 Nagrada Časnika Finance za posebne dosežke v gospodarstvu [9]
2019 Listina Slovenske Bistrice[11] za dr. Viktorja Marklja in Marjana Pipenbaherja
2018 Republika Slovenija /Puhovo nagrado za vrhunske dosežke na področju projektiranja mostov[12]
2017 Nagrada Inženirske zbornice Slovenije za večkratne izjemne inženirske dosežke[13]
2017 Nagrada izraelskega združenja gradbenih inženirjev za izjemne inženirske dosežke za most Bridge no. 10 v Izraelu[14]
2013 Društvo gradbenih inženirjev in tehnikov Maribor / DGIT Maribor, Naziv Častni član za izjemne dosežke na področju razvoju gradbeništva
2009 Društvo gradbenih inženirjev in tehnikov Maribor / DGIT Maribor, Priznanje, - Naziv Inženir leta[2]
2006 Priznanje družbe DRC za raziskave v cestni in prometni stroki za izjemne inženirske dosežke na področju projektiranja premostitvenih objektov in velik prispevek pri razvoju cestne stroke
2004 IZS - Nagrado Inženirske zbornice Slovenije za izjemne inženirske dosežke[15]
2004 Univerza v Mariboru, Zlata plaketa[16] : Zlata plaketa Marjanu Pipenbaherju in Viktorju Markelju