Najverjetneje je bila v Komendi lastniška cerkev v okviru mengeške pražupnije. V kraju je bil sedež župnije in župnik Altvin se omenja v neki listini za Vetrinj, datirani med 1147 in 1154. Malteški red, naseljen 1223, se prvič omenja 1403, in v njihovi posesti župnija ostane do 1799. Župnija se v tem času imenuje po sv. Petru iz Gozda. Upravno je spadala do 1750 pod oglejski patriarh, nato do 1757 pod goriško nadškofijo in nato pod ljubljansko.
V župniji Komenda so postavljene Farne spominske plošče, na katerih so imena vaščanov iz okoliških vasi (Breg, Gmajnica, Gora, Klanec, Komenda, Komendska Dobrava, Križ, Mlaka, Moste, Nasovče, Podboršt, Suhadole, Žeje), ki so padli kot žrtve revolucionarnega nasilja v letih 1942-1945. Skupno je na ploščah 62 imen[2].