Mária bola veľmi krásna žena s modrými očami a červenohnedými vlasmi, typickými znakmi členov rodu Trastamarovcov, potomkov Petra I. Kastílskeho.
Manželstvo
Máriini rodičia pôvodne plánovali jej sobáš so škótskym kráľom Jakubom IV.; v tej dobe sa jej mladšia sestra Katarína vydala za anglického následníka trónu, princa Artúra, a Katolícke Veličenstva dúfali, že dve sestry ako dve kráľovné susedných krajín, Anglicka a Škótska, dokážu udržať mier medzi svojimi manželmi. Plány však stroskotali keď v roku 1498 zomrela Máriina staršia sestra Izabela, manželka portugalského kráľa Manuela I. V rámci pokračovania politiky sobášov medzi kráľovskými rodinami Španielska a Portugalska sa 30. októbra 1500 Mária v Alcazar de Sal vydala za Manuela I. Toto manželstvo umožňovalo Manuelovi plánovať budúce zjednotenie kráľovstiev Iberského polostrova pod jeho vládou.
Okrem ďalších výsad a darov kráľ daroval manželke ako veno mestá Viseu a Torres Vedras.
Mária bola horlivou stúpenkyňou Manuelových snáh majúcich za ciel zničenie islamských svätých miest Mekky a Mediny, obsadenie území ovládaných moslimami a spätného dobytia svätých miest kresťanských, najmä Jeruzalema. Rovnako tak podporovala svojho manžela v jeho snahách o "očistenie" Portugalska od Židov a moslimov.
Deti
Z manželstva Márie a Manuela trvajúceho 17 rokov sa narodilo desať detí, osem z nich sa dožilo dospelosti: