Bordet promoval v roku 1892 na doktora medicíny a v roku 1894 začal pracovať v Pasteurovom inštitúte v Paríži. V laboratóriu Elie Metchnikoffa opísal fagocytózu baktérií bielymi krvinkami. V roku 1898 vyhlásil, že pridanie cudzieho krvného séra vyvoláva hemolýzu.
V roku 1899 sa oženil s Marthou Levozovou. Z manželstva sa narodil syn a dve dcéry.
V roku 1900 opustil Paríž a založil Pasteurov inštitút v Bruseli. Objavil časť krvného séra alexín (dnes komplement), ktorý spolu s protilátkou zabíja baktérie. Tento objav umožnil vznik diagnostických testov na mnohé ochorenia.
V roku 1907 sa stal profesorom bakteriológie na Université Libre de Bruxelles. V roku 1940 odišiel do dôchodku a jeho syn Paul Bordet sa stal jeho nástupcom v Pasteurovom ústave.
Bordet bol slobodomurár a člen slobodomurárskej lóže v Bruseli.[1]
