Moussa Latoundji (Porto-Novo, 13. kolovoza 1978.) je umirovljeni beninski nogometaš i reprezentativac, aktualni v.d. izbornik reprezentacije Benina. Latoundji je jedan od rijetkih beninskih nogometaša koji je ostvario uspješnu međunarodnu karijeru; nakon igranja za B momčad Metza, Latoundji je sedam sezona igrao za njemački Energie Cottbus, za kog je skupio čak 120 nastupa.
Za reprezentaciju Benina nastupao je od 1993. do 2004. godine, umirovivši se nakon debitantskog nastupa svoje zemlje na Afričkom kupu nacija u Tunisu. Latoundji je na tom turniru ušao u historiju kao prvi strijelac Benina na Kupu nacija, nakon što je postigao počasni gol u porazu svoje momčadi protiv Nigerije (2:1) u grupnoj fazi.
Trenerskim poslom bavi se od 2009. godine, vodeći najprije svoj bivši klub Dragons de l'Ouémé, a od 2015. godine i gabonski Cercle Mbéri Sportif.