Glacier Bay je udaljen oko 160 km sjeverozaopadno od grada Juneaua, ima površinu od 13.290 km², a dubok je nekih 80 km.[1] Širina mu varira do najviše 24 km, prosječna dubina iznosi 240 m, a najviša je 430 m. Oko zaljeva ima čitav niz spektakularnih glečera koji se kližu s planinskih masiva Saint Eliasa na istoku i Fairweathera na zapadu. Većina od nekoliko desetaka glečera u tom području su planinski, ali su nekoliko njih klasificirani kao plimni glečeri (oni koje direktno kližu u ocean). Po zaljevu ima brojnih otoka, bez ijednog drvo, a stanište su hiljadama morskih ptica koje koriste njihove stijene kao svoj zaklon.
