Ahern je trenutno predmet istrage koja se tiče isplata na njegov račun sredinom 1990-ih. Zbog toga je prisiljen svjedočiti pred Mahonovim tribunalom. Obrativši se medijima ispred vladinih zgrada 2.4.2008 je najavio kako će napustiti položaj Taoiseacha (i vođe Fianna Fáila) na dan 6.5.2008.[1]