В 1750 году по повелению императрицы Елизаветы Петровны было устроено Лазаревское кладбище, как первое городское кладбище. Место было выбрано за городской чертой, там, где и прежде хоронили нищих и безродных людей. (Такие места называли «божедомками»). Для поминовения умерших на кладбище был возведён деревянный храм в честь Воскресения праведного Лазаря Четверодневного, откуда кладбище и получило своё название.
Строительство современного храма велось с 1782-го по 1787 год на средства Титулярного советника московского купца 1-й гильдии Луки Ивановича Долгова (1722-1783)[источник не указан 409 дней]. В 1932 году храм был закрыт. В 1936 году было уничтожено и Лазаревское кладбище, а на месте погребения умерших устроен детский парк «Фестивальный».
Согласно свидетельству очевидцев, храм был приговорен богоборцами к полному разрушению, вслед за храмом Христа Спасителя, но по непонятной причине уцелел. Храм был объявлен памятником архитектуры первой категории и тем самым спасен от разрушения и устройства в нём колумбария (предположительно, сотрудниками Главнауки и Центральных реставрационных мастерских).
Здание, объявленное памятником архитектуры, не только продолжало частично эксплуатироваться, но было доведено до последней степени аварийного состояния, местами — до руин. Это хорошо видно на фотографиях (старожилы свидетельствуют, что бомбардировке эти места не подвергались).
Росписи замазывались первой попавшейся краской. Внутри храм был перестроен, часть окон заложена кирпичом, на втором этаже располагалось то общежитие, разрушавшее бытовыми испарениями остатки росписей, то школа.
В настоящее время храм восстановлен, в нём совершаются регулярные богослужения.
Главный придел освящён в честь Сошествия Святого Духа на Апостолов, правый придел — во имя святого апостола Луки, небесного покровителя Луки Ивановича, левый — во имя святого праведного Лазаря Четверодневного, епископа Киттийского, в память о первом деревянном храме, который был разобран (в настоящее время на этом месте футбольное поле).
Весь комплекс Лазаревского кладбища, включая кладбищенскую церковь, спроектирован Е. С. Назаровым. В архитектурный ансамбль входило пять зданий и каменная ограда кладбища. В настоящее время из зданий сохранилось только одно — бывшая богадельня, остальное разрушено при советской власти.
Фрески ротонды и первые иконы были написаны известными итальянскими мастерами Клаудио и Скотти. Также в соответствии с западным стилем, было много лепных украшений, полностью уничтоженных при разорении храма. Трапезную часть расписывали неизвестные живописцы.
В 1903—1904 годах трапезная часть храма (включая приделы) увеличена по проекту архитектора Воскресенского, и колоколенки, венчавшие западный фасад, были в том же виде перемещены.
Здания храма и богадельни состоят на государственной охране как памятники архитектуры XVIII века.
Клирики, служившие в храме
XVIII—XIX века
Сведения из исторического исследования священника Владимира Остроухова «Московское Лазарево кладбище», Москва, 1893 г.
Середина XVIII в. — священник Андрей, Иванов сын;
Настоятель с 1806 г. — священник Феодор Стефанов Владыкин;
Настоятель с 1828 г. — священник Илья Иванов Смирнов;
Настоятель с 1833 г. — священник Иван Николаевич Померанцев;
Настоятель с 1885 г. священник Владимир Остроухов — автор исторического исследования о Лазаревском кладбище.
XX век
Настоятель с 1914 года — протоиерейНиколай Алексеевич Скворцов (1861—1917), председатель Археологического отдела Общества любителей духовного просвещения, основоположник автор капитальных трудов в области церковной археологии. Вместе с супругой, матушкой Евгенией, убит бандитами-грабителями — похоронены на Лазаревском кладбище. При перенесении на Ваганьковское кладбище в 1930-х годах оба тела были найдены нетленными.
Настоятель, затем с 1922 года — заштатный священник протоиерей Александр Ив. Соколов, умирая в декабре 1932 года, стал пророчествовать, что будут открыты все храмы, в том числе храм на Лазаревском кладбище.
мать Ф. М. Достоевского — М. Ф. Достоевская (1837), тетка — А. Ф. Куманина;
Долгов Лука Иванович (1722—1783) — титулярный советник, московский купец первой гильдии. На его средства был построен Храм Сошествия Святого Духа на Лазаревском кладбище[источник не указан 409 дней].
Известные люди, имеющие отношение к храму
В храме на Лазаревском кладбище любил бывать св. Патриарх-исповедник Тихон. Он довольно часто служил здесь в двадцатых годах. Резиденция Святейшего помещалась недалеко, на Троицкой горке, где теперь подворье Троице-Сергиевой Лавры. Присутствовал Святейший Тихон и при погребении на Лазаревском кладбище св.прав. Алексия Мечева. Лишь накануне освободившись из тюрьмы, он приехал сюда на извозчике через весь город, облачился на паперти, так как храм был тогда временно захвачен обновленцами, и произнес слово на могиле почившего, будучи встречен самыми горячими проявлениями народной любви.
Вспоминают также, что Патриарх должен был служить в храме на Лазаревском кладбище и в Лазареву субботу 1925 года. Но прихожане, пришедшие на службу в тот день, увидели объявление, сообщавшее о кончине Святейшего и о порядке прощания с ним.