Самопровозглашённое государство Пунтленд объявило о своей независимости в 1998 году. В новом государстве Абди Хаши занимал пост вице-президента с августа 1998 по октябрь 2004 года[5][6]. После того как президент Пунтленда Абдуллахи Юсуф Ахмед был избран временным президентом Сомали, Мухаммед Абди Хаши стал временным президентом до следующих президентских выборов 8 января 2005 года[7].