Афгано-Таджикская и Ферганская впадины контролируют одноименные, давно разрабатываемые, нефтегазоносные области с мезо-кайнозойским нефтегазонакоплением. В Афгано-Таджикской нефтегазоносной области промышленная нефтегазоносность известна с 1934 г. (Хаудаг), в Ферганской — с 1880 г. (Шорсу, Чимион).
Три последние впадины являются перспективными на нефть и газ территориями.
К высокоперспективным территориям Тянь-Шань-Памирской нефтегазоносной провинции относятся Зайсанская, в меньшей степени Илийская и Алакольская межгорные впадины.