В этом списке приведены небоскрёбы префектуры Нагасаки с высотой от 60 метров, основанные на стандартных измерениях высоты. Эта высота включает шпили и архитектурные детали, но не включает антенны радиовышек и башен.

Рейтинг	Название	Фото	Высота м	Высота до крыши	Этажность	Год	Город	Примечания
-	Hario Radio Towers		137			1922	Сасебо	Башни 1 и 2 135 метров, башня 3 137 метров. Важный культурный памятник Японии Important Cultural Property (Japan)[англ.]
-	Huis Ten Bosch (theme park)[англ.] Domtoren		105		5	1992	Сасебо
1	Tower city Nagasaki		95.0		28	2004	Нагасаки	[1][2]
2	Nagasaki University Hospital		67.7	62.1	14	2008	Нагасаки
3	Hotel Nikko Huis Ten Bosch		66.3		12	1995	Сасебо	[3]
4	Best Western Premier Hotel Nagasaki		65		15	1990	Нагасаки
5	MJR Dejima Bayside Tower		64.28		19	2013	Нагасаки	[4]

• [1]
• [2]
• [3]