Существующая версия происхождения названия деревни соединяет в себе финно-угорское «систа» — чистая, от названия реки на которой стоит деревня и русское «палкино» — от фамилии возможного владельца деревни или крестьянина с распространённым в средние века новгородским именем Палка[3].
Она же на шведской «Генеральной карте провинции Ингерманландии» 1704 года обозначена как швед.Seedstapalkina[7].
Селение Систер Палкина обозначено на «Географическом чертеже Ижорской земли» Адриана Шонбека 1705 года[8]. Оно же, как деревня Систа — на карте Ямбургского, Капорского, Псковского, Новгородского и Гдовского уездов 1705 года[9].
СИСТА ПАЛКИНА — деревня принадлежит статской советнице Юрьевой, число жителей по ревизии: 134 м. п., 125 ж. п.[11] (1838 год)
В имении вдовы генерал-майора Жандра при деревне Систа, на реке стояла каменная мукомольная мельница[12].
В 1844 году деревня Систо-Пакина насчитывала 28 дворов[13].
СИСТО ПАЛКИНА — деревня статской советницы Юрьевой, по просёлочной дороге, число дворов — 36, число душ — 131 м. п.[14] (1856 год)
План деревни Систо-Палкино. 1860 год
Согласно «Топографической карте частей Санкт-Петербургской и Выборгской губерний» в 1860 году деревня Систо Палкина насчитывала 38 крестьянских дворов и часовню. На противоположном берегу реки располагались: кирпичный завод, харчевня и мыза Зиновьева.
СИСТА-ПАЛКИНА — деревня владельческая при реке Систе на приморском просёлочном тракте, в 67 верстах от Петергофа, число дворов — 42, число жителей: 161 м. п., 176 ж. п.[15] (1862 год)
В 1871 году в деревне была открыта земская школа. Жители занимались рыбной ловлей и перевозкой грузов по Финскому заливу[16].
В 1880—1881 годах временнообязанные крестьяне деревни выкупили свои земельные наделы у Д. В. Зиновьева и стали собственниками земли[17].
СИСТЯ (СИСТА ПАЛКИНА) — деревня бывшая владельческая при реке Систе, дворов — 64, жителей — 368; 2 лавки[18]. (1885 год)
В конце XIX — начале XX века деревня административно относилась к Копорской волости 2-го станаПетергофского уезда Санкт-Петербургской губернии. По приходским данным население деревни было смешанным — финско-русским[19].
С 1917 по 1923 год деревня Систо-Палкино входила в состав Систо-Палкинского сельсовета Копорской волости Петергофского уезда.
С 1923 года в составе Керновского сельсовета Троцкого уезда.
С 1924 года в составе Пограничного сельсовета.
Согласно данным переписи населения СССР 1926 года в деревне Систа-Палкино Керновского (4-го пограничного) сельсовета проживали 348 человек — большинство русские, а также эстонцы[20].
В 1928 году население деревни Систо-Палкино составляло 370 человек[21].
По административным данным 1933 года деревня называлась Систо Палкино и входила в состав Пограничного сельсовета Ораниенбаумского района. В состав Пограничного сельсовета Ораниенбаумского района входили 7 населённых пунктов: деревни Керново Новое, Керново Старое, Копёрки Большие, Копёрки Малые, Новое Устье, Перново и Систо Палкино, общей численностью населения 1004 человека. Административным центром сельсовета являлась деревня Новое Керново[22].
По данным 1936 года в состав Пограничного сельсовета входили 4 населённых пункта, 114 хозяйств и 3 колхоза. Административным центром сельсовета было село Систо Палкино[23].
План деревни Систо-Палкино. 1938 год
Согласно топографической карте 1938 года деревня называлась Систа-Палкино и насчитывала 69 дворов. На южной окраине деревни находилась школа.
Деревня была освобождена от немецко-фашистских оккупантов 30 января 1944 года[24].
С 1950 года в составе Калищенского сельсовета.
С 1960 года в составе Устьинского сельсовета.
С 1963 года в составе Гатчинского района.
С 1965 года вновь в составе Ломоносовского района. В 1965 году население деревни Систо-Палкино составляло 103 человека[21].
По данным 1966 и 1973 годов деревня называлась Систа-Палкино и также находилась в составе Устьинского сельсовета[25][26].
По данным 1990 года деревня называлась Систо-Палкино и находилась в административном подчинении Сосновоборского городского совета[27].
В 1997 году в деревне проживали 30 человек, в 2007 году — 47[28][29].
В 2016 году на кладбище близ деревни был построен и освящён деревянный храм-часовня в честь Всех Святых.
.jpg){kind=link}