Государство возникло в результате революции 9 октября 1820 года. Эта революция положит начало войны за независимость Эквадора от Испанской империи.
Двадцать три дня после революции, в среду, 8 ноября, был учреждён Конгресс Свободной провинции Гуаякиль. Именно этот орган будет разрабатывать указы, и разработает конституцию.
Её основные положения содержали элементы либерализма, такие как свобода торговли, добровольная военная служба (за исключением случаев войны), право выбора. Начала зарождаться отмена рабства, например, указ о том, что дети рабов будут свободны.
Административное деление
Свободная провинция Гуаякиль — унитарное государство. Свободная провинция Гуаякиль включала в себя те же территории, что и во время её подчинения Испанской империи, включая земли от Эсмеральдаса на севере и до Тумбеса на юге, а также между Тихим океаном на западе и предгорьями хребта Анды на востоке. Она охватывала большую часть побережья Эквадора, нынешние эквадорские провинции, часть провинций современного Перу.
Внешняя политика
Большинство государств того времени не видели Гуаякиль серьёзным противником на политической арене, и не обращали на него внимание.
Первичной целью революционеров был захват провинции Кито. Вполне возможно, что правители Гуаякиля стремились к созданию независимой республики на территориях провинции Кито.
После обретения независимости правительство провинции сформировало армию численностью 1500 человек для освобождения Кито.
Генерал Антонио де Сукре прибыл в Гуаякиль с колумбийским вспомогательным отрядом из 700 вооруженных и экипированных людей в августе 1821 года и сражался вместе с армией Гуаякиля против испанцев, которые все ещё угрожали независимости провинции. Гуаякильско-колумбийская армия под командованием де Сукре одержала победу в битве при Ягуачи, окончательно обеспечив независимость Свободной провинции Гуаякиль от Испанской империи.
После, вместе с колумбийскими войсками, они атаковали войска испанцев, и завершили полное освобождение 24 мая 1822 года в битве при Пичинче, где флаг Гуаякиля развевался рядом со знаменами Великой Колумбии.
Присоединение к Великой Колумбии
11 июля 1822 года Боливар прибыл в Гуаякиль. Произошла Гуаякильская конференция.
Боливар считал присоединение провинции к Великой Колумбии стратегическим. Боливар, при поддержке военных, устроил государственный переворот, провозгласил себя лидером провинции и издал указ об интеграции Гуаякиля в Великую Колумбию, игнорируя протесты прошлого правительства Гуаякиля .
31 июля 1822 года Свободная провинция Гуаякиль объявила об официальном присоединении к Великой Колумбии. По этой причине Гуаякиль стал юго-западным округом Великой Колумбии, вместе с департаментом Эквадор со столицей в Кито. Он стал носить название Департамент Гуаякиль со столицей в Гуаякиле.