Поверхность Хиршфельда

Поверхность Хиршфельда — математическое понятие, описывающее характер взаимодействия молекул (в том числе заряженных молекул и сложных многоатомных ионов) между собой, в отличие от химических связей, описывающих взаимодействие внутри молекул. Один из современных подходов, используемых для описания молекул в современной кристаллографии.

Данный подход представляет собой попытку выйти за рамки существующей парадигмы — межъядерных расстояний и углов, диаграмм упаковки кристаллов с молекулами, представленными с помощью различных моделей, и идентификация тесных контактов, которые считаются важными, а рассматривать молекулы как «органическое целое», тем самым принципиально заменив обсуждения частных межмолекулярных взаимодействий (включая силы Ван-дер-Ваальса, водородные связи, пи-стэкинг, дисперсионные силы и др.) на беспристрастную идентификацию и количественную оценку совокупности всех коротких контактов (сохранив возможность разделения этих взаимодействий по их типам). Особое значение такой подход может иметь для биомолекул. Доступное описание метода приведено в учебнике[1].

Поверхность Хиршфельда (ПХ) возникла в результате попытки определить пространство, занимаемое молекулой в кристалле, с целью разделения электронной плотности кристалла на молекулярные фрагменты[2]. Поверхности Хиршфельда были названы в честь Ф. Л. Хиршфельда. Оригинальная статья Хиршфельда об этом разделении на сегодняшний день привлекла около 800 ссылок, из них более 75 % — за последние пять лет. Он предложил схему разделения электронной плотности в кристалле и весовую функцию для каждого атома в молекуле[3].

В настоящее время для расчёта поверхности Хиршфельда используется программа CrystalExplorer[англ.] en:CrystalExplorer.

Некоторые примеры применения поверхности Хиршфельда [1][4][5]. Для сравнительно простых молекул поверхность Хиршфельда может быть сгенерирована прямо на сайте журнала Acta Crystallographica Sec.E — Crystallographic Communications, например для катиона морфолиния, пройдя на страницу оригинальной статьи[6] , при нажатии на панели слева кнопки 3D-view, попадаешь на страницу, где имеется опция «сгенерировать поверхность Хиршфельда» и, после выделения желаемого фрагмента, получается следующее изображение:

Cation of morpholinium in its perchlorate salt

В программе CrystalExplorer имеется возможность оценить вклады различных видов взаимодействия (стэкинг, водородные связи, вандерваальсовы, дисперсионное и др.) в общий баланс межмолекулярных взаимодействий в рассматриваемой молекуле, или проследить их изменение в ряду молекул. В последнее время в кристаллохимических статьях использование поверхности Хиршвельда стало важным элементом заключительной части исследования.

Примечания

  1. ↑ Афанасьев А.В., Белова Е.В., Герман К.Э., Новиков А.П. Номенклатура, электронное строение органических соединений и новые подходы к оценке их реакционной способности. — M.: Издательский дом "Граница", 2022. — С. 89—109. — 110 с. — ISBN 978-5-9933-0408-3. Архивировано 17 февраля 2023 года.
  2. ↑ Mark A. Spackman, Dylan Jayatilaka. Hirshfeld surface analysis (англ.) // CrystEngComm. — 2009-01-07. — Vol. 11, iss. 1. — P. 19–32. — ISSN 1466-8033. — doi:10.1039/B818330A. Архивировано 18 февраля 2023 года.
  3. ↑ F. L. Hirshfeld. Bonded-atom fragments for describing molecular charge densities (англ.) // Theoretica chimica acta. — 1977-06-01. — Vol. 44, iss. 2. — P. 129–138. — ISSN 1432-2234. — doi:10.1007/BF00549096.
  4. ↑ A. P. Novikov, A. A. Bezdomnikov, M. S. Grigoriev, K. E. German. Synthesis, crystal structure and Hirshfeld surface analysis of 2-(perfluorophenyl)acetamide in comparison with some related compounds (англ.) // Acta Crystallographica Section E: Crystallographic Communications. — 2022-01-01. — Vol. 78, iss. 1. — P. 80–83. — ISSN 2056-9890. — doi:10.1107/S2056989021013359. Архивировано 18 февраля 2023 года.
  5. ↑ Anton Petrovich Novikov, Mikhail Alexandrovich Volkov, Alexey Vladimirovich Safonov, Mikhail Semenovich Grigoriev. Synthesis, Crystal Structure, and Hirshfeld Surface Analysis of Hexachloroplatinate and Tetraclorouranylate of 3-Carboxypyridinium—Halogen Bonds and π-Interactions vs. Hydrogen Bonds (англ.) // Crystals. — 2022-02. — Vol. 12, iss. 2. — P. 271. — ISSN 2073-4352. — doi:10.3390/cryst12020271. Архивировано 18 февраля 2023 года.
  6. ↑ Mikhail S. Grigoriev, Konstantin E. German and Alesia Ya. Maruk. Morpholinium perchlorate (англ.) // Acta Cryst. Sec. E - Crystallographic Communications : журнал. — 2008. — February (vol. 64, no. 2). — P. o390. — ISSN = 2056-9890 issn = 2056-9890. Архивировано 24 февраля 2023 года.

Read other articles:

Kualuh Selatan, Labuhanbatu Utara

Kualuh SelatanKecamatanKantor Kecamatan Kualuh SelatanPeta lokasi Kecamatan Kualuh SelatanNegara IndonesiaProvinsiSumatera UtaraKabupatenLabuhanbatu UtaraPemerintahan • Camat- SUHERMAN SIAGIAN SE.MSiPopulasi • Total51,039 jiwa (2.001) jiwaKode Kemendagri12.23.08 Kode BPS1223050 Luas344,51 km²Desa/kelurahan1 kelurahan 11 desa Kualuh Selatan adalah sebuah kecamatan di Kabupaten Labuhanbatu Utara, Sumatera Utara, Indonesia. Pariwisata Di Kecamatan Kualuh Selatan ter...

 

دوري جزر فارو الممتاز 1943

دوري جزر فارو الممتاز 1943 تفاصيل الموسم دوري جزر فارو الممتاز  البلد الدنمارك  مباريات ملعوبة 19   عدد المشاركين 12   دوري جزر فارو الممتاز 1942  دوري جزر فارو الممتاز 1945  تعديل مصدري - تعديل   دوري جزر فارو الممتاز 1943 هو موسم من دوري جزر فارو الممتاز. فاز فيه Tvøroyr...

 

Sistem pertahanan udara portabel

SA-7 Soviet sedang digunakan. Sistem pertahanan udara portabel (MANPADS atau MPADS) adalah rudal darat-ke-udara portabel. MANPADS adalah senjata dipandu dan merupakan ancaman bagi pesawat terbang rendah, terutama helikopter. Ikhtisar MANPADS dikembangkan pada 1950-an untuk memberikan pasukan darat militer perlindungan dari pesawat jet. Mereka telah menerima banyak perhatian, sebagian karena kelompok-kelompok bersenjata telah menggunakannya melawan pesawat komersial. Rudal-rudal ini, yang terj...

List of acts of the Parliament of the United Kingdom from 2018

Part of a series onBritish law Acts of Parliament of the United Kingdom Year      1801 1802 1803 1804 1805 1806 1807 1808 1809 1810 1811 1812 1813 1814 1815 1816 1817 1818 1819 1820 1821 1822 1823 1824 1825 1826 1827 1828 1829 1830 1831 1832 1833 1834 1835 1836 1837 1838 1839 1840 1841 1842 1843 1844 1845 1846 1847 1848 1849 1850 1851 1852 1853 1854 1855 1856 1857 1858 1859 1860 1861 1862 1863 1864 1865 1866 1867 1868 1869 1870 1871 1872 1873 1874 1875 1876 1877 1878 ...

 

Edward Ochab

Polish politician Edward OchabOchab c. 1950sFirst Secretary of the Polish United Workers' PartyIn office20 March 1956 – 21 October 1956Prime MinisterJózef CyrankiewiczChairmanAleksander ZawadzkiPreceded byBolesław BierutSucceeded byWładysław GomułkaChairman of the Council of State of the People's Republic of PolandIn office12 August 1964 – 10 April 1968Prime MinisterJózef CyrankiewiczFirst SecretaryWładysław GomułkaPreceded byAleksander ZawadzkiSucceeded byMaria...

 

1876 New Hampshire gubernatorial election

New Hampshire gubernatorial election 1876 New Hampshire gubernatorial election ← 1875 14 March 1876 1877 →   Nominee Person Colby Cheney Daniel Marcy Party Republican Democratic Popular vote 41,761 38,133 Percentage 51.99% 47.48% Governor before election Person Colby Cheney Republican Elected Governor Person Colby Cheney Republican Elections in New Hampshire Federal government Presidential elections 1788–89 1792 1796 1800 1804 1808 1812 1816 1820 1824 1828 18...

Bureau Township (Illinois)

Cet article est une ébauche concernant l’Illinois. Vous pouvez partager vos connaissances en l’améliorant (comment ?) selon les recommandations des projets correspondants. Bureau Township Administration Pays États-Unis État Illinois Comté Bureau Type de localité Township Code ZIP 61356, 61376, 61379 Code FIPS 17-011-09668 GNIS 428735 Démographie Population 236 hab. (2010) Densité 2,5 hab./km2 Géographie Coordonnées 41° 26′ 50″ nord, 89° ...

 

Hideo Kojima

Artikel ini perlu diterjemahkan dari bahasa Inggris ke bahasa Indonesia. Artikel ini ditulis atau diterjemahkan secara buruk dari Wikipedia bahasa Inggris. Jika halaman ini ditujukan untuk komunitas bahasa Inggris, halaman itu harus dikontribusikan ke Wikipedia bahasa Inggris. Lihat daftar bahasa Wikipedia. Artikel yang tidak diterjemahkan dapat dihapus secara cepat sesuai kriteria A2. Jika Anda ingin memeriksa artikel ini, Anda boleh menggunakan mesin penerjemah. Namun ingat, mohon tidak men...

 

Jam Kiamat

Jam Kiamat pada tahun 2020, digambarkan 100 detik menuju tengah malam Jam Kiamat (Inggris: Doomsday Clock) adalah jam simbolis yang mewakili kemungkinan risiko bencana global buatan manusia. Simbol ini dikelola sejak tahun 1947 oleh Bulletin of the Atomic Scientists di University of Chicago, Amerika Serikat. Semakin dekat mereka mengatur jam hingga tengah malam, semakin dekat mereka percaya dunia mengalami bencana global. Pada awalnya, Jam Kiamat, yang menggantung pada dinding kantor Bull...

WDUN (AM)

Radio station in Gainesville, GeorgiaWDUNGainesville, GeorgiaBroadcast areaAtlanta metropolitan areaFrequency550 kHzBrandingNorth Georgia's News/Talk AM 550 & FM 102.9 WDUNProgrammingFormatNews/talkAffiliationsFox News RadioPremiere NetworksSalem Radio NetworkWestwood OneMotor Racing NetworkPerformance Racing NetworkAtlanta FalconsGwinnett GladiatorsGeorgia SouthernGainesville High SchoolOwnershipOwnerJacobs Media CorporationSister stationsWDUN-FMWGGAHistoryFirst air dateApril 2, 1949Form...

 

Nikolaus Biewer

Questa voce sull'argomento calciatori tedeschi è solo un abbozzo. Contribuisci a migliorarla secondo le convenzioni di Wikipedia. Segui i suggerimenti del progetto di riferimento. Nikolaus Biewer Nazionalità  Germania Saar (1950-1956) Germania Ovest (dal 1956) Calcio Ruolo Difensore Carriera Squadre di club1 1943-1955 Saarbrücken58+ (?) Nazionale 1950-1954 Saar11 (0) 1 I due numeri indicano le presenze e le reti segnate, per le sole partite di campionato.Il simbolo →...

 

趙家驤

追晉陸軍二級上將趙家驤將軍个人资料出生1910年 大清河南省衛輝府汲縣逝世1958年8月23日(1958歲—08—23)（47—48歲） † 中華民國福建省金門縣国籍 中華民國政党 中國國民黨获奖 青天白日勳章（追贈）军事背景效忠 中華民國服役 國民革命軍 中華民國陸軍服役时间1924年－1958年军衔 二級上將 （追晉）部队四十七師指挥東北剿匪總司令部參謀長陸軍�...

2021 UCI Road World Championships – Women's road race

Cycling race Cycling race Women's road race2021 UCI Road World ChampionshipsPodium of the women's road raceRace detailsDates25 September 2021Stages1 in Leuven, BelgiumDistance157.7 km (97.99 mi)Winning time3h 52' 27Medalists   Gold  Elisa Balsamo (ITA)   Silver  Marianne Vos (NED)   Bronze  Katarzyna Niewiadoma (POL)← Imola 2020 Wollongong 2022 → Events at the 2021 UCIRoad World ChampionshipsParticipat...

 

Rama Shama Bhama

2005 film by Ramesh Aravind Rama Shama BhamaDirected byRamesh AravindWritten byYashwant Sardeshpande, Rajendra Karanth (dialogues)Screenplay byRamesh AravindStory byBalu MahendraBased onSathi Leelavathi (1995)by Balu MahendraProduced byK. ManjuStarring Ramesh Arvind Kamal Haasan Urvashi Shruthi Daisy Bopanna Anirudh CinematographyPKH DasEdited byNagendra UrsMusic byGurukiranProductioncompanyLakshmishree CombinesDistributed byRaaj Kamal Films InternationalRelease date 9 December 2005...

 

Міністерство оборони України

Міністерство оборони України (Міноборони) Емблема Міністерства оборони та Прапор Міністерства оборони Будівля Міністерства оборони у КиєвіЗагальна інформаціяКраїна  УкраїнаДата створення 24 серпня 1991Попередні відомства Міністерство оборони СРСР Народний комісарі...

赫瓦贾·纳齐姆丁

His Excellency赫瓦贾·纳齐姆丁爵士খাজা নাজিমুদ্দীন خواجہ ناظِمُ الدّین‬‎CIE, KCIE摄于1948年第2任巴基斯坦總理任期1951年10月17日—1953年4月17日君主佐治六世伊莉沙白二世总督古拉姆·穆罕默德前任利雅卡特·阿里·汗继任Mohammad Ali Bogra（英语：Mohammad Ali Bogra）第2任巴基斯坦總督（英语：Governor-General of Pakistan）任期1948年9月14日—1951年10月17日君�...

 

1999–2000 Indiana Hoosiers men's basketball team

American college basketball season 1999–2000 Indiana Hoosiers men's basketballNCAA tournament, First RoundConferenceBig Ten ConferenceRankingAPNo. 22Record20–9 (10–6 Big Ten)Head coachBobby Knight (29th season)CaptainA.J. GuytonHome arenaAssembly HallSeasons← 1998–992000–01 → 1999–2000 Big Ten Conference men's basketball standings vte Conf Overall Team W   L   PCT W   L   PCT No. 2 Michigan State† 13 – 3   .813 ...

 

Universitas Gajayana Malang

Untuk kegunaan lain, lihat Gajayana (disambiguasi). Artikel ini tidak memiliki referensi atau sumber tepercaya sehingga isinya tidak bisa dipastikan. Tolong bantu perbaiki artikel ini dengan menambahkan referensi yang layak. Tulisan tanpa sumber dapat dipertanyakan dan dihapus sewaktu-waktu.Cari sumber: Universitas Gajayana Malang – berita · surat kabar · buku · cendekiawan · JSTOR Universitas Gajayana MalangUniga MalangNama sebelumnya Akademi Manajemen Perusahaan dan Akuntasi Ma...

Dobrovelychkivka Raion

Former subdivision of Kirovohrad Oblast, Ukraine Raion in Kirovohrad Oblast, UkraineDobrovelychkivka Raion Добровеличківський районRaion FlagCoat of armsCoordinates: 48°22′10″N 31°9′48″E / 48.36944°N 31.16333°E / 48.36944; 31.16333Country UkraineRegionKirovohrad OblastEstablished1923Disestablished18 July 2020Admin. centerDobrovelychkivkaSubdivisions List   1 — city councils  1 — settlement counci...

 

History of Education Quarterly

US peer-reviewed academic journal Academic journalHistory of Education QuarterlyDisciplineHistory of educationLanguageEnglishEdited byA.J. Angulo, Jack SchneiderPublication detailsFormer name(s)History of Education JournalHistory1949–presentPublisherCambridge University Press, on behalf of the History of Education SocietyFrequencyQuarterlyStandard abbreviationsISO 4 (alt) · Bluebook (alt1 · alt2)NLM (alt) · MathSciNet (alt )ISO 4Hist. Educ. Q.I...