Рафи Мило, сын Ури и Евы, родился и вырос в мошавеКфар-Йедидия. Он назван в честь его дяди, майора Рафи Мило, офицера спецподразделения «Шайетет 13», погибшего в ходе операции «Эскорт[ивр.]» в сентябре 1969 года[1].
В 1996 году после шестилетней службы был освобождён от действительной службы. Впоследствии он вернулся в часть в 1997 году. Позже он перешел в бригаду «Голани» и стал заместителем командира подразделения «Эгоз». После этого он служил командиром разведывательного подразделения Голани во время Второй интифады[3].
В 2003 году ему было присвоено звание подполковника, и он был назначен командиром 13-го батальона бригады «Голани» и прослужил в этой должности до ноября 2005 года[4]. В ноябре 2005 года он командовал бригадой во время трансграничного рейда «Хезболлы» в 2005 году и участвовал в ликвидации одного из боевиков «Хезболлы»[5]. В том же месяце израильтянин, который занимался серфингом со скалы Манара, дрейфовал в сторону ливанской территории. Рафи Мило, который удерживал оборону в этом секторе со своим батальоном, прибыл на место происшествия и начал спасательную операцию под огнём «Хезболлы», после того как они тоже увидели пловца и подошел к нему, чтобы похитить, а он пересек забор и спас мирного жителя. За действия по предотвращению похищения гражданина и ухудшения ситуации с безопасностью на северной границе он был награждён благодарностью от командующего Северным командованием Уди Адама[6][7]. В 2005 году он был назначен командиром истребительной эскадрильи Шайетет-13 и прослужил на этой должности до 2007 года. Руководил ею, в том числе, во Второй ливанской войне. Во время войны он возглавил основные силы в операции «Негевский лес». За участие в войне, в том числе в этой операции, командующий ВМФ Давид Бен-Бешт наградил его[8][7].
В 2008 году ему было присвоено звание полковника и он был назначен командиром бригады «Эциони», во время службы там он потерял персональный компьютер, на котором хранились секретные файлы и информация. Начальник штаба Габи Ашкенази определил в качестве наказания, что его назначение в 2010 году на должность командира Шайетет 13 будет отменено, а его возможное продвижение на эту должность будет отложено на два года. 25 августа 2010 года он был назначен командиром территориальной бригады «Барам», и занимал эту должность до июня 2012 года. 19 июня 2012 года он был назначен командиром Шайетет-13, на этой должности он служил до 2 июля 2014 года[9]. По окончании службы он уехал учиться в Колледж национальной безопасности в Канаде.
29 июля 2015 года Рафи Мило было присвоено звание бригадного генерала и он был назначен командиром 80-й территориальной дивизии «Эдом», в которой он служил до 24 мая 2017 года[10]. 18 июля 2017 года он был назначен командиром 91-й территориальной дивизии «Галилея»[11]. Во время службы на этой должности он руководил операцией «Северный щит». По окончании операции он решил самостоятельно и без согласования со своими командирами осмотреть другую сторону одного из туннелей «Хезболлы», самого большого из них, и прошёл во главе небольшого отряда вдоль туннеля до его конца, в деревне Рамия на юге Ливана[7]. В результате руководитель аппарата Авив Кохави решил объявить ему выговор и отложить его повышение в должности до 2022 года[12]. Он завершил свою работу 12 августа 2019 года. В октябре 2019 года он был назначен командующим Командно-штабным колледжем ЦАХАЛа[7].
В мае 2020 года он объявил, что намерен уйти со своей должности и уйти с военной службы[9], но в июле 2020 года он отказался от своего заявления и заявил, что не уйдет из ЦАХАЛа[13][14]. 30 июня 2022 года ему было присвоено звание генерал-майора (Алуф), а 18 июля он приступил к исполнению обязанностей командующего Командованием тыла[11][15].