Сам Ицхак Леви, впервые став депутатом в 1988 году, оставался в кнессете до 1999 года (12—15-й созывы) и с 2003 по 2009 год (16-й и 17-й созывы). В кнессете 12-го созыва возглавлял комиссию по этике и специальную комиссию по вопросу насилия над детьми в семье, входил в финансовую и законодательную комиссию (членом последней также был в последующих созывах кнессета)[2]. Был автором законодательных инициатив в социальной сфере, возглавял парламентское лобби по охране детства[3].
После выборов 1999 года партия МАФДАЛ во главе с Леви стала членом правящей коалиции Эхуда Барака. Получив в новом правительстве портфель министра строительства, Леви освободил место в кнессете для следующего кандидата в партийном списке МАФДАЛа (которым стал Нахум Лангенталь[4]). Но уже в 2000 году МАФДАЛ покинул коалицию в связи с разногласиями по внешнеполитическим вопросам[3].
В ноябре 2000 года, вскоре после начала интифады Аль-Аксы, в теракте на рынке «Махане Иегуда» в Иерусалиме погибла дочь Ицхака Леви, 28-летняя Айелет Ха-Шахар[5]. МАФДАЛ присоединился к правящей коалиции Ариэля Шарона в апреле 2002 года, на фоне нового обострения отношений с ПНА. Леви, освободивший пост председателя партии в пользу Эфи Эйтама, стал министром без портфеля, а в сентябре возглавил министерство туризма. После выборов 2003 года Леви получил пост заместителя министра по делам религий, но это министерство вскоре было распущено, и Леви стал заместителем министра при администрации премьер-министра, сохранив под своим контролем большую часть функций, ранее осуществлявшихся министерством по делам религий[3].
В 2004 году в связи с выдвинутым премьер-министром Ариэлем Шарономпланом одностороннего размежевания в МАФДАЛе произошёл идеологический раскол. В то время как большая часть партии поддержала дальнейшее участие в правящей коалиции, Леви и Эйтам вышли из неё и в феврале 2005 года сформировали в кнессете отдельную фракцию «Обновленное национально-религиозное движение», присоединившуюся к правому блоку «Ихуд леуми»[3]. Леви успешно был избран в кнессет 17-го созыва от этого блока в 2006 году[2], но в декабре 2008 года заявил об уходе из политики[6].
Ицхак Леви женат, отец пятерых детей, проживает в религиозном мошаве Бейт-Маймон[4]. После ухода из кнессета участвует в работе некоммерческих общественных и образовательных организаций[3].