21января1938 года арестован вместе с группой духовенства, служившего в храмах Ухтомского района Московской области и заключен в Таганскую тюрьму[2].
Фрагмент допроса священника Василия Коклина:
— Следствием установлено, что вы, состоя членом контрреволюционной организации, руководителем которой являлся благочинный Воздвиженский, вели активную контрреволюционную деятельность. Признаете ли вы это?
— Нет, это я отрицаю.
— Следствием установлено, что вы выражали пораженческие настроения по отношению к советской власти. Признаете ли вы это?
— Нет, это я отрицаю и виновным себя в контрреволюционной деятельности не признаю.
Поскольку отец Василий отказывался признать себя виновным, ему устроили очную ставку со священником той же церкви, где он служил, Сергием Сахаровым, согласившимся после ареста давать нужные следствию показания:
— Сергей Николаевич Сахаров подтверждает, что вы являетесь членом контрреволюционной группы духовенства, руководителем которой был Владимир Федорович Воздвиженский, и вели активную борьбу против советской власти. Признаете ли вы это?
— Нет, это я отрицаю.
Тройка НКВД приговорила священника Василия Коклина к расстрелу 15марта1938.