Водохранилища комплекса были введены в эксплуатацию в 1950, 1962 и 1980 годах. Общая площадь водохранилища в советское время составляла примерно 15 млн м³. Использовалась для орошения около 10 тысяч гектаров территории. В водохранилище текла вода также из реки Куручай[1].
В результате Первой карабахской войны и перехода в 1993 году территории водохранилища под контроль непризнаннойНагорно-Карабахской Республики, здания и сооружения комплекса пришли в запустение и стали подвергаться разрушениям. Осенью 2020 года в ходе боевых действий во время Второй карабахской войны Азербайджан вернул под свой контроль всю территорию Физулинского района, в том числе и территорию водохранилища. После этого правительство Азербайджана начало ремонт и восстановление всех трёх водохранилищ комплекса[2].
10 мая 2024 года Кенделанчайское водохранилище было вновь введено в эксплуатацию[2].