Свою профессиональную карьеру Кавагути начал в клубе «Йокогама Ф. Маринос», за который он отыграл 7 лет. Удачно проявив себя в составе сборной Японии на Кубке Азии и Кубке конфедераций, он получил предложение от английского «Портсмута», в который и перешёл в 2001 году. Не сумев закрепится в основном составе английского клуба, он перешёл в датский «Норшелланн», где также не смог стать основным вратарём. В 2005 году Кавагути вернулся в Японию, перейдя в клуб «Джубило Ивата». Далее защищал ворота клубов «Гифу» и «Сагамихара».
В национальной сборной Ёсикацу Кавагути выступал с 1997 по 2008 год. За это время он провёл в её составе 116 матчей, что является шестым показателем в истории японской сборной.