В 1894 году в Коломне возник эстонский православный приход во главе с настоятелем Павлом Кульбушем. К этому времени в Петербурге проживало около 4 тысяч православных эстонцев. У прихода не было своей церкви, и богослужения совершались в подвале Малоколоменской Воскресенской церкви. 29 ноября 1898 года по инициативе настоятеля прихода было открыто эстонское Братство во имя священномученика Исидора Юрьевского. Кульбуш также выступил инициатором постройки церкви для прихода, проект которой был поручен члену общества архитектору Александру Полещуку.
В 1901 году архитектор составил эскиз, а 23 августа 1902 года был утверждён окончательный проект трёхпридельной бесстолпной церкви на 720 человек. Сбор средств на строительство церкви осуществлялся по всей России, а первое пожертвование сделал Иоанн Кронштадтский. В проект также входил примыкающий дом для школы с общежитием, залом для бесед, книжным складом и библиотекой. Сначала был построен церковный дом и деревянная часовня, освящённая 30 марта 1903 года, а 24 августа 1903 года состоялась закладка каменного пятиглавого храма. На втором этаже церковного дома, в двусветном зале для бесед организовали временную церковь. Иконостас и образа для неё исполнило Общество взаимопомощи русских художников. 21 декабря 1903 года епископ Гдовский Константин, при участии Иоанна Кронштадтского освятил алтарь временной церкви во имя Исидора Юрьевского. Чуть позже, 7 февраля 1904 года, был освящён её Серафимовский придел.
В 1905 году, когда стены строящейся церкви были доведены до сводов, деньги иссякли. Положение спас председатель строительного комитета действительный статский советник Иван Богданов, пожертвовавший на строительство 50 тысяч рублей. Три тысячи рублей дал Николай II. В результате строительство храма удалось закончить в 1907 году.
Позднее фирмой Франка был изготовлен запрестольный витраж. Трёх- и двухъярусные иконостасы в стиле барокко были исполнены в мастерской П. С. Абросимова по рисункам Полещука. Образа для них были написаны Василием Перминовым. В 1910—1912 годах в мастерской Карла Гвиди престолы были облицованы белым каррарским мрамором.
C 1923 по 1927 год в здании работали Богословские курсы Центрального района (Петрограда — Ленинграда), преобразованные в 1925 году в Высшие Богословские курсы, ректором которых стал протоиерей Николай Чуков.
Вид с северо-востока
25 февраля 1935 года церковь была окончательно закрыта, часть имущества передана в близлежащий Николо-Богоявленский собор. В сентябре 1937 года был расстрелян священномученик протоиерей Карп Эльб, служивший в эстонском приходе города на Неве с 1899 года диаконом, а с 1918 − священником; в январе 1938 года − настоятель церкви (с 1918 по 1935 год) протоиерейАлександр Пакляр. После сильной переделки внутри здание долгие годы было занято живописно-оформительским комбинатом Художественного фонда СССР.
В 1994 году церковь была возвращена епархии; первая литургия была совершена в нижнем храме 30 октября 1994 года. 4 июля 1996 года над храмом поднят крест, в 1999 году начато восстановление верхней церкви, в 2001 году открыта Никольская часовня.
Реставрация верхнего храма Святого Исидора завершена. Восстановлен барочный иконостас, настенные росписи. Изготовлен запрестольный витраж с изображением Иисуса Христа. С сентября 2006 года налажены постоянные богослужения в приделе Исидора. В 2007 году, в столетие первого освящения, храм был заново освящён митрополитом Санкт-Петербургским и Ладожским Владимиром (Котляровым). Отреставрирован также и нижний храм Святителя Николая Чудотворца[источник не указан 989 дней].
В храме действуют библиотека и приходская воскресная школа.
Литература
Свято-Исидоровская церковь. История храма. Жития святых. 1907—2007. 100 лет со дня первого освящения храма. — СПб., 2007. — 64 с.
Костромин К., свящ., Самойленко Е. Столетие Свято-Исидоровского храма // Вода живая. Санкт-Петербургский церковный вестник. — № 11 (94), 2007. — С. 26-27.
Костромин К. А., свящ Свято-Исидоровская церковь сегодня и сто лет назад // Коломенские чтения — 2008. Альманах № 3 / Под ред. В. В. Антонова. СПб.: Арденн, 2009. — С. 51-66.
Костромин К. А., прот. Свято-Исидоровский приход и его причт в 1917 году // Православные эстонцы Петербурга. 1917: до и после (Материалы научно-просветительской конференции Санкт-Петербург, 8 октября 2017 года); Житие священномученика Платона, епископа Ревельского; Житие священномученика Карпа, пресвитера Петроградского / Сост. и ред. прот. К. Костромин. СПб., 2017. — С. 18-32.
Наследие священномученика Платона, епископа Ревельского. к 150-летию со дня рождения, к 100-летию мученического подвига священномученика Платона, епископа Ревельского (протоиерея Павла Кульбуша): материалы научно-просветительской конференции. Составитель и редактор протоиерей Константин Костромин. — СПб., 2019. — 72 с. — ISBN 978-5-6040140-1-1
