Антисуворов. Большая ложь маленького человечка. — М.: Яуза, 2004. — 352 с. — (Война и мы). — 5000 экз. — ISBN 5-699-05998-0. (переиздание: Эксмо, 2006 г., 4000 экз.; 2007 г., 3000 экз.)
Антисуворов. Десять мифов Второй мировой. — М.: Эксмо, 2004. — 416 с. — (Война и мы). — 10 000 экз. — ISBN 5-699-07634-4.
Исаев А. В. Берлин 45-го. Сражения в логове зверя. — М.: Яуза; Эксмо, 2007. — 720 с. — (Война и мы). — 10 000 экз. — ISBN 978-5-699-20927-9.
Исаев А. В. От Дубно до Ростова. — М.: АСТ; Транзиткнига, 2004. — 710 с. — ISBN 5-17-022744-2
Исаев А. В. 1941: Бои на Украине. — М.: Стратегия КМ, 2004. — 80 с. — ISBN 5-901266-01-3
Исаев А. В. Краткий курс истории ВОВ. Наступление маршала Шапошникова. — 384 с. — 8000 экз. — ISBN 5-699-10769-X.[6] — М.: Яуза, 2005. — 332 с. — ISBN 1-699-43532-0
Битва за Харьков. Февраль-март 1943 года. — М.: Стратегия КМ, 2005. — 80 с. — (Фронтовая иллюстрация).
Исаев А. В. Когда внезапности уже не было. История ВОВ, которую мы не знали. — М.: Эксмо; Яуза, 2005. — 479 с. — ISBN 5-699-11949-3
Исаев А. В. «Котлы» 41-го. История ВОВ, которую мы не знали.[7] — М.: Эксмо; Яуза, 2005. — 400 с. — ISBN 5-699-12899-9
Пять кругов ада : Красная Армия в «котлах». — М.: Яуза: Эксмо, 2008. — 396 с. (1941) ISBN 978-5-699-28995-0
Пять кругов ада. Красная Армия в «котлах». — М.: Яуза: Эксмо, 2017. — 396 с. (Оболганные победы Сталина) ISBN 978-5-699-98921-8 : 1500 экз.
Исаев А. В. Георгий Жуков. Последний довод короля[8] — М.: Эксмо, 2006. — 480 с. — ISBN 5-699-16564-9
Исаев А. В. Прорыв «Миус-фронта» июль-август 1943 года. — М.: Стратегия КМ, 2006. — 80 с. — ISBN 5-901266-01-3.
Исаев А. В. Сталинград. За Волгой для нас земли нет. — М.: Эксмо, Яуза, 2008. — 448 с. — (Война и мы). — 10 000 экз. — ISBN 978-5-699-26236-6.
2-е доп. издание издавалось под названием Мифы и правда о Сталинграде. — М.: Яуза: Эксмо, 2011. — 477 с. (Бестселлеры Алексея Исаева) ISBN 978-5-699-45745-8
3-е дополненное издание вышло под названием «Неизвестный Сталинград. Как перевирают историю» (М., 2012)
Исаев А. В. Великая Отечественная альтернатива. 1941 в сослагательном наклонении. — М.: Яуза; Эксмо, 2011. — 288 с. — ISBN 978-5-699-52235-4
Исаев А. В. «Белые пятна» 1945 года. Агония Рейха. — М.: Яуза; Эксмо, 2012. — 3450 с. (Бестселлеры Алексея Исаева) ISBN 978-5-699-54782-1
Исаев А. В. Падение Берлина. Последняя битва Великой Отечественной. — М.: Яуза; Эксмо, 2012. — 350 с. (Бестселлеры Алексея Исаева) ISBN 978-5-699-55951-0
Освобождение 1943. «От Курска и Орла война нас довела…». — М.: Эксмо, Яуза, 2013. — 554 с. — (Война и мы). — 4000 экз. — ISBN 978-5-699-61508-7.
Исаев А. В. Сталинград: иллюстрированная энциклопедия. — М.: Эксмо : Яуза, 2014. — 270 с. (Генеральные сражения Великой Отечественной) ISBN 978-5-699-66377-4
Исаев А. В. Операция «Багратион». «Сталинский блицкриг» в Белоруссии. — М.: Яуза; Эксмо, 2014. — 448 с. — ISBN 978-5-699-72841-1
Исаев А. В., Хазанов Д. Б., Романько О. В., Глухарев Н. Н. Битва за Крым 1941—1944 гг. — М.: Яуза; Эксмо, 2016. — 896 с. — ISBN 978-5-699-92485-1
Исаев А.В. Вторжение. 22 июня 1941 года. — М.: Яуза-каталог, 2016.
Исаев А. В. «Котёл» Хубе: Проскуровско-Черновицкая операция 1944 года. — М.: Яуза: Якорь, 2017. — 413 с. (Война и мы. Военное дело глазами гражданина) ISBN 978-5-906716-92-7 : 2500 экз.
Исаев А. В. Курская битва. Всё о сражении, решившем судьбу Второй Мировой. — М.: Эксмо: Яуза, 2018. — 367 с. (Генеральные сражения Великой Отечественной. Иллюстрированная энциклопедия) ISBN 978-5-04-093486-7 : 1000 экз.
Исаев А. В. Города-крепости Третьего рейха: битва за фестунги: иллюстрированная энциклопедия. — М.: Эксмо: Яуза, 2018. — 127 с. ISBN 978-5-9955-0993-6 : 700 экз.
Исаев А. В. 22 июня 41-го. Первая иллюстрированная энциклопедия. — М.: Яуза, 2018. — 143 с. (Главные сражения Великой Отечественной) ISBN 978-5-9955-0998-1 : 1000 экз.
Исаев А. В., Драбкин А. В. История Великой Отечественной войны 1941—1945 гг. в одном томе. — М.: Яуза : Якорь, 2018. — 574 с. (Подлинная история великих войн) ISBN 978-5-04-093289-4 : 2000 экз.
Исаев А. В., Драбкин А. В. Великая Отечественная война 1941—1945: самая полная энциклопедия. — М.: Яуза : Якорь, 2018. — 703 с. (Уникальная военная энциклопедия. Сотни эксклюзивных иллюстраций) ISBN 978-5-04-096651-6 : 1500 экз.
Исаев А. В. Чудо под Москвой. — М.: Яуза, 2019. — 448 с. (Война и мы) ISBN 978-5-9955-1013-0
Книги в соавторстве
Авторский коллектив. Подвиг 2-й ударной армии. Любанская наступательная операция (рус.) / под общей редакцией А. В. Драбкина. — М.: Яуза-каталог, 2022. — 704 с. — 1500 экз. — ISBN 978-5-00155-517-9.
Авторский коллектив. Донбасс 1943. Освобождение индустриального сердца России (рус.) / под общей редакцией А. В. Драбкина. — М.: Яуза-каталог, 2023. — 736 с. — 2000 экз. — ISBN 978-5-00155-605-3.
Статьи
Исаев А. В. Инструмент блицкрига // От Буга до Кавказа. Герман Гейер. IX армейский корпус в Восточном походе 1941 года. Эберхард Макензен. От Буга до Кавказа. III танковый корпус в компании против Советской России 1941—1942. — М.: АСТ, Транзиткнига, 2004. — С. 354—377.
Исаев А. В. Примитивная сложность катастрофы // 1941. Великая Отечественная катастрофа. Итоги дискуссии. — М.: Яуза, 2009. — С. 5—31.
Исаев А. В. «Но разведка доложила неточно…» // Мифы Великой Отечественной-2: сборник. — М.: Яуза, Эксмо, 2009. — С. 5—44.
Исаев А. В. Организация подготовки кадров НКВД МВД МГБ СССР в послевоенный период 1945 1953 гг // Право и образование. — 2011. — № 4. — С. 137—142.
Исаев А. В. Советский Союз: подготовка страны к обороне // 1941: документы и материалы к 70-летию начала Великой Отечественной войны: в 2-х т. / Сост. Ю. А. Никифоров, к.и.н. и др. — СПб.: Президентская библиотека имени Б. Н. Ельцина, 2011. — С. 132—144.
Исаев А. В. Война и политика: взаимное влияние и противоречия. На примерах операций на советско-германском фронте в 1944—1945 годах // Преподавание истории в школе. — 2016. — № 4. — С. 3—7
Исаев А. В. Крымская ошибка Манштейна // Военно-исторический журнал. — 2016. — № 3. — С. 27—30 : 4 фот., схема. ISSN 0321-0626
↑Также издавалась под названием «Наступление маршала Шапошникова. История ВОВ, которую мы не знали» (М., 2005) и «АнтиБЛИЦКРИГ Красной Армии. От победы под Москвой до Харьковской катастрофы» (М., 2011)
↑Переиздавалась под названием «Пять кругов ада. Красная Армия в „котлах“» (М., 2008)
↑Переиздавалась под названием «Мифы и правда о Маршале Жукове» (М., 2010)
↑Переиздавалась под названием «Битва за Берлин. Флаг над Рейхстагом» (М., 2010)
↑Переиздавалась под названием «Последние контрудары Гитлера. Разгром Панцерваффе» (М., 2010)
↑Состоит из немного дополненной первой части книги «Иной 1941», первых четырёх глав книги «Неизвестный 1941» и полностью книги «Дубно 1941».