Свою историю институт начинает с 1958 года, когда в Институте математики СО АН СССР был создан Отдел программирования, возглавляемый Андреем Петровичем Ершовым. В 1964 году Отдел программирования был переведен в организованный тогда Вычислительный центр СО АН СССР. Шестидесятые и семидесятые годы стали временем роста Отдела и расширения тематики научных исследований. В круг интересов А.П. Ершова, его коллег и учеников вошли, кроме разработки компиляторов, многие другие задачи системного и теоретического программирования, проблематика искусственного интеллекта, эксперименты в области архитектуры ЭВМ. Таким образом была создана Сибирская школа системного и теоретического программирования, занимающая заметные позиции во многих областях научных исследований. Институт систем информатики был создан в 1990 году на базе коллектива, который многие годы возглавлял А.П. Ершов, в соответствии с распоряжением Совета Министров СССР от 10.11.1989 г. В 1995 г. ИСИ СО РАН было присвоено имя академика А.П. Ершова. В сентябре 1997 года ИСИ СО РАН вошёл в Объединенный институт информатики Сибирского отделения Российской академии наук. В 1998 году в соответствии с Федеральным законом «О науке и государственной научно-технической политике» Институт систем информатики им. А.П. Ершова СО РАН получил государственную аккредитацию Министерства науки и технологий Российской Федерации в качестве научно-исследовательского учреждения.
Структура
Лаборатория теории параллельных процессов
Лаборатория теоретического программирования
Лаборатория информационных систем
Лаборатория искусственного интеллекта
Лаборатория смешанных вычислений
Лаборатория системного программирования
Лаборатория конструирования и оптимизации программ