7 ноября 1853 года Иван Евгеньевич Лаговский был назначен учителем логики и психологии в Пермскую духовную семинарию; 8 апреля 1856 года рукоположен во священника[1].
В 1858 году он был возведён в сан протоиерея и назначен благочинным к Введенскому собору горного Богословского завода и законоучителем в горном училище. Через три года И. Е. Лаговский был переведён к Пермской тюремной церкви и преподавателем в Пермской семинарии[1].
С 7 октября 1868 года он был ректором семинарии; в 1869 году был избран в члены комитета для чтения катехизических бесед[1].
23 февраля 1874 году Иван Евгеньевич Лаговский постригся в монашество с именем Иероним и был возведен в сан архимандрита[1].
12 сентября 1879 года Иероним Лаговский был назначен членом Петербургского духовно-цензурного комитета[1].
Во время службы в Пермской духовной семинарии отец Иероним по документам её архива составил «Историю Пермской семинарии» в 3-х томах; кроме того, ему принадлежит труд «Библейская археология» (2 тт., СПб., 1883, 1884)[1], где исчерпывающим образом были использованы труды немецких богословов; этот труд был удостоен половинной Макариевской премии[2].
Иероним Лаговский умер 29 апреля (11 мая) 1884 года в городе Санкт-Петербурге[3].
Его лекции по основному богословию были изданы в виде литографированных записок[1].