После войны продолжал службу в ВВС командиром авиаэскадрильи в Молдавии. С марта 1947 года — в Саратовском аэроклубе на аэродроме Дубки: начальник лётной части (март-апрель 1947), командир отряда первоначального обучения (с апреля 1947 года).
За мужество и героизм, проявленные в боях, указом Президиума Верховного Совета СССР от 15 мая1946 года капитану Зарубину Владимиру Степановичу присвоено звание Героя Советского Союза с вручением ордена Ленина и медали «Золотая Звезда».
Награждён также тремя орденами Красного Знамени (11.09.1943, 7.11.1943, 17.01.1945), орденами Александра Невского (18.08.1944), Отечественной войны 1-й степени (25.12.1943) и Красной Звезды (13.06.1945), медалями.