После захвата власти АНС была преобразована в Движение национального сопротивления, которое с 2005 года стала политической партией. В марте 1986 года политические партии были запрещены. Партийная идеология с революционного марксизма сменилась на экономический прагматизм и неолиберализм, стали проводиться рыночные реформы. Экономические успехи привели к тому, что Уганда стала одной из наиболее динамично развивающихся стран в Восточной Африке. Рост экономики в 1990 — начале 2000-х годах составлял в среднем 7 % в год[4].
В 1996 году Мусевени одержал победу на президентских выборах, набрав более 72 % голосов, и переизбран на выборах 2001 года. В 2005 году было упразднено ограничение в два президентских срока. на референдуме 2005 года в Уганде была восстановлена многопартийная система[4].
Мусевени переизбирался на выборах 2006, 2011 и 2016 годов с большим отрывом от конкурентов. В 2018 году Мусевени подписал конституционный закон об отмене возрастных ограничений на право занимать пост президента, чтобы баллотироваться на выборах 2021 года[4].
