В марте 1918 года А. К. Андерс добровольно вступил в РККА, 15 апреля 1918 года был назначен начальником штаба Рязанского отряда (с 16 июля 1918 года — 1-я Рязанская пехотная дивизия). 24 сентября 1-я Рязанская пехотная дивизия была расформирована, части направлены на формирование 2-й пехотной дивизии (с 18 ноября — 2-я Тульская стрелковая дивизия), А. К. Андерс был назначен начальником её штаба. Одновременно, с 16 августа по 22 ноября 1918 года А. К. Андерс вр.и.д. начальника штаба 5-й армииВосточного фронта, воевал против армии КОМУЧа и Чехословацкого корпуса.
С 8 мая 1919 года по 6 января 1920 года А. К. Андерс — начальник штаба 4-й армии Восточного фронта, с 18 марта по 29 апреля 1920 года — начальник штаба Туркестанского фронта, с 1 мая по 1 октября 1920 года — помощник командующего Заволжского военного округа, с 5 октября 1920 года — помощник командира 6-й армии, с 9 декабря 1920 года — помощник начальника штаба Южного фронта.
В июле 1924 года А. К. Андерс зачислен в резерв РККА, зачислен в распоряжение правления Добролёта, был членом его правления и заместителем директора. Позднее — инспектор для поручений при начальнике Аэрофлота, пенсионер.
В Москве проживал по адресу: ул. 5-я Тверская-Ямская, д. 4а, кв. 43. Беспартийный.
31 октября 1937 года А. К. Андерс был арестован, 26 апреля 1938 года ВКВС СССР был приговорен к ВМН по обвинению в участии в контр-революционной террористической организации[3], расстрелян в тот же день на Коммунарке.
Реабилитирован 14 июля 1956 года.
Семья
А. К. Андерс был женат на Ольге Борисовне Озеровой (племянница фрейлины Елены Александровны Озеровой, жены С. А. Нилуса). У Андерсов было по меньшей мере трое детей: Елена (1905—1924; замужем за К. К. Алкалаевым), Борис (1907—1931) и Александр (1909—1979).
Черушев Н. С., Черушев Ю. Н. Расстрелянная элита РККА (командармы 1-го и 2-го рангов, комкоры, комдивы и им равные): 1937—1941. Биографический словарь. — М.: Кучково поле; Мегаполис, 2012. — С. 170—172. — 2000 экз. — ISBN 978-5-9950-0217-8.