Ford Flex 2009 года имеет семь мест для сидения, включая регулируемые и съёмные подставки для ног у пассажиров на заднем сиденье. Сиденья второго и третьего ряда складываются к полу. Автомобиль имеет характерный для кроссоверов необязательный внутренний «минихолодильник» в средней стойке между сиденьями второго ряда. Управляемая голосом система связи и развлечений, называемая Ford Sync и разработанная совместно с Microsoft, объединяет функции сотового телефона, спутникового радио СИРИУС, проигрывателя компакт-дисков, DVD-дисков и других носителей и навигационной системы. Интерьер освещается программируемым «светом под настроение», имеющим семь цветов, а также мультипанелью Vista Roof, похожей на панель в Ford Edge, в качестве потолочного света. Навигационная система находится на жёстком диске для хранения музыки и изображений.