5-й отдельный моторизованный инженерный батальон — воинская часть в вооружённых силах СССР во время Великой Отечественной войны.
Сформирован в Московском военном округе в июле-августе 1941 года.
В составе действующей армии с 11 сентября 1941 по 19 октября 1942 года. В середине сентября 1941 года поступил в распоряжение 54-й армии, осуществлял инженерное обеспечение войск армии в Синявинских операциях сентября-октября 1941 года, в Тихвинских оборонительной и наступательной операциях, Любанской наступательной операции.
В августе 1942 года передан в 8-ю армию, где ведёт боевые действия в ходе Синявинской операции 1942 года, в сентябре 1942 года обеспечивает ввод в прорыв под Синявино войск 2-й ударной армии
19 октября 1942 года переформирован в 13-й отдельный инженерно-сапёрный батальон.