Картина «Птицы, сироты и безумцы»[8] 1969 года была отправлена «на полку», где пролежала до 1991 года. Сам режиссёр был практически лишён возможности снимать в течение последующих пятнадцати лет. Исключением были несколько короткометражных документальных лент и фильм «Три мешка цемента и живой петух» (1976), но и он был показан лишь через два года после того, как был закончен. Окончательно вернулся в кино с картиной «Построй дом, посади дерево» (1979).
Во многих своих фильмах («Сижу на ветке и мне хорошо», «Лучше быть здоровым и богатым, чем бедным и больным», «Батори» и др.) обращался к разным периодам истории Чехии и Чехословакии.
В 2000 году по итогам опроса кинокритиков и журналистов был признан лучшим словацким режиссёром XX века[9].
Преподавал в Пражской киноакадемии. В 2005 году возглавил жюри конкурса «Перспективы» на XXVII Московском кинофестивале. Основал студию «Якубиско Филм», на которой снял ряд своих картин.
Занимался живописью, его работы были представлены на нескольких выставках.
Был женат на актрисе Деане Хорватовой, которую много снимал в своих фильмах. Жил в Праге.
↑Birds, Orphans, and Fools (неопр.). Программа по словакистике. Университет Питсбурга. Дата обращения: 17 июня 2010. Архивировано из оригинала 5 июня 2010 года.