В первые месяцы войны Павел Швыдкой отступал до Новгорода, после чего был вызван в Москву, где учил гражданских инженеров сапёрному делу.
Возглавляя инженерные войска 65-й армии с ноября 1942 года, генерал-майор инженерных войск Швыдкой обеспечил частям и соединениям успешное форсирование многих водных преград, в частности Дона, Десны, Сожа, Днестра, Вислы, Одера и многих других рек.
Своё высокое инженерное мастерство, инициативу и изобретательность Швыдкой показал в Сталинградской и Курской битвах. Одним из любимых изречений было: «На сапёрный глаз сойдёт». Данное заключение принималось командирами всех рангов.
Во время Сталинградской битвы Швыдкой выступил с идеей оснащения пехоты отрядами сапёров: по его инициативе от каждого взвода выделялись по три-четыре человека для прохождения спецкурса инженерного дела. Эта инициатива в то время спасла многие жизни.
Когда весной 1943 года 65-я армия заняла оборону на северной части Курского выступа, под непосредственным руководством Павла Швыдкого было вырыто к маю 1943 года более тысячи километров траншей, были подготовлены многочисленные минные поля, а также сооружались и совершенствовались другие инженерные сооружения. В это время Военный Совет армии согласился с предложением Павла Швыдкого о создании в каждой дивизии подвижных отрядов минёров.
Во время форсирования Днепра под руководством Павла Швыдкого сапёры построили мост под груз до 60 тонн через Днепр длиной в 400 метров за одни сутки. Удостовериться в этом факте приезжал инженер из Москвы.
Во время наступления на Бобруйск Павел Швыдкой обеспечил успешное наступление 65-й армии: так как на левом фланге и в центре обороны гитлеровцев была слабая оборона из-за нахождения на тех участках болот, именно в этом направлении было решено нанести главный удар. Павел Швыдкой вместе со своими инженерами в болотистых местах тыла 65-й армии для испытаний построил гати для прохода танков. После удачного прохождения танков по гатям в тылу советских войск началось строительство на передней линии. Для этой цели были направлены все инженерные войска, а также некоторые войска из второго эшелона. Строительством гатей Павел Швыдкой руководил лично. Впоследствии Георгий Жуков назвал эту операцию инженерной.
При форсировании реки Одер южнее города Штеттин с 20 по 24 апреля1945 года гитлеровская артиллерия восемь раз разбивала наведенные переправы. Но несмотря на беспрерывный огонь противника, командуемые генерал-майором Швыдким инженерные части в короткий срок отстраивали переправы. И в течение четырёх суток через Одер была полностью переправлена вся армия со средствами усиления и танковый корпус. Павел Швыдкой всё время был на переправе и лично руководил работами инженерно-понтонных частей.
В честь Павла Васильевича Швыдкого названа Артемовская средняя школа Чутовского района, в которой он учился. В самой школе установлена мемориальная доска.
